27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44296 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  100 
 
 
289 aa  577  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44461  predicted protein  27.34 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.844276  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  29.41 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  30.36 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  29.52 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  29.88 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  30.34 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  24.87 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  29.74 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32960  predicted protein  29.49 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.219119 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  24.35 
 
 
313 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46392  predicted protein  28.11 
 
 
436 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0744  hypothetical protein  26.71 
 
 
265 aa  58.9  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  25.25 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  25.25 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  25.25 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  29.11 
 
 
259 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  24.14 
 
 
265 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  30.87 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2993  hypothetical protein  30.27 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42787  predicted protein  26.4 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0920905  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  32.84 
 
 
256 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2231  hypothetical protein  23.96 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397252  normal  0.947267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1069  hypothetical protein  29.89 
 
 
240 aa  50.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  32.09 
 
 
256 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  29.61 
 
 
260 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  32.47 
 
 
261 aa  45.8  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>