32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1424 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  620  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  37.28 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  35.58 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  33.92 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  33.92 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  33.92 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  32.95 
 
 		 267 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  33.01 
 
 		 265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  36.28 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  37.61 
 
 		 262 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  32.86 
 
 		 256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  33.49 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  32.85 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  28.1 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  30.48 
 
 		 260 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  25.64 
 
 		 259 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  29.49 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0744  hypothetical protein  26.5 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  26.53 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5204  hypothetical protein  27.22 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2231  hypothetical protein  22.14 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397252  normal  0.947267 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  24.38 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2993  hypothetical protein  24.32 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  25.68 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1069  hypothetical protein  24.26 
 
 		 240 aa  49.3  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  18.94 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  25.19 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  23.53 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04450  hypothetical protein  26.09 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  23.73 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42787  predicted protein  21.56 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0920905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>