37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02585 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  541  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  47.22 
 
 
261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  35.8 
 
 
269 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  36.36 
 
 
257 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  33.33 
 
 
313 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  29.82 
 
 
265 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  30.09 
 
 
278 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  30.09 
 
 
278 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  30.09 
 
 
278 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  30.14 
 
 
265 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  32.61 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  34.95 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  30.64 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  31.15 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  32.33 
 
 
262 aa  96.3  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  29.28 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  34.95 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0744  hypothetical protein  28.62 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  29.19 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2231  hypothetical protein  26.55 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397252  normal  0.947267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2993  hypothetical protein  27.55 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  25.89 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  28.8 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  25.36 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  25.81 
 
 
244 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1069  hypothetical protein  26.03 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  30.43 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5204  hypothetical protein  26.95 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1437  putative integral membrane protein  21.39 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  30.84 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  26.23 
 
 
310 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32960  predicted protein  23.62 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.219119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  32.12 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0886  hypothetical protein  27.81 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0897  hypothetical protein  27.81 
 
 
262 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0880  hypothetical protein  27.81 
 
 
262 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  26.01 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>