34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0454 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  45.15 
 
 
310 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  41.7 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  39.91 
 
 
276 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04450  hypothetical protein  43.17 
 
 
301 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  43.67 
 
 
259 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  39.39 
 
 
267 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1437  putative integral membrane protein  42.79 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  27.84 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  29.77 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  29.9 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  22.84 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  28 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  33.73 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  30.72 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  29.7 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  29.59 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  27.51 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0744  hypothetical protein  23.74 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  24.64 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  24.1 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2231  hypothetical protein  31.72 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397252  normal  0.947267 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5204  hypothetical protein  26.83 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3295  putative integral membrane protein  42.72 
 
 
330 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.179488  decreased coverage  0.00096704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  25.56 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  26.14 
 
 
259 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1069  hypothetical protein  30.67 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0886  hypothetical protein  42.67 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.502493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  32.12 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0897  hypothetical protein  42.67 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0880  hypothetical protein  42.67 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2690  hypothetical protein  29.33 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0496  hypothetical protein  26.32 
 
 
316 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  33.1 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>