38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4215 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  58.8 
 
 
256 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  54.51 
 
 
260 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  58.37 
 
 
256 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  43.08 
 
 
259 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  38.91 
 
 
257 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  33.48 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  34.91 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  34.08 
 
 
269 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  35.68 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  35.68 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  35.68 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  36.41 
 
 
262 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  32.85 
 
 
313 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  32.56 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  30.64 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  34.25 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  27.31 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  32.09 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  29.08 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  41.89 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2231  hypothetical protein  27.75 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397252  normal  0.947267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  27.41 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0496  hypothetical protein  26.19 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5204  hypothetical protein  25.29 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1437  putative integral membrane protein  27.49 
 
 
282 aa  62.4  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  25.28 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2993  hypothetical protein  26.55 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42787  predicted protein  27.55 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0920905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  26.95 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1069  hypothetical protein  27.57 
 
 
240 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  22.77 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32960  predicted protein  26.67 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.219119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  30.38 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4024  hypothetical protein  29.92 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3295  putative integral membrane protein  36.67 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.179488  decreased coverage  0.00096704 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44461  predicted protein  24.31 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.844276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  35.59 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>