37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5493 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  36.36 
 
 		 313 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  39.91 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  37.1 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  39.71 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  41.15 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  41.15 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  41.15 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  42.18 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  34.25 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  31.15 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  33.18 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  28.97 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  34.91 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  32.75 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  33.18 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  31.53 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  41.91 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2231  hypothetical protein  28.27 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397252  normal  0.947267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  31.29 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  30.34 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  33.85 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0744  hypothetical protein  29.09 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  35.14 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04450  hypothetical protein  31.35 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1069  hypothetical protein  26.05 
 
 		 240 aa  52.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  28.76 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  29.33 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5204  hypothetical protein  27.11 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1437  putative integral membrane protein  33.57 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  34.21 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  25.6 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32960  predicted protein  26.17 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.219119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  25.13 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  30.23 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0496  hypothetical protein  28.36 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46392  predicted protein  24.2 
 
 		 436 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>