32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  51.71 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  54.22 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  48.23 
 
 
276 aa  131  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  43.32 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1437  putative integral membrane protein  43.6 
 
 
282 aa  112  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04450  hypothetical protein  46.54 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  38.91 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  35.76 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  28.8 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  30.47 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  38.24 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  34.76 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  35.19 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3295  putative integral membrane protein  44.39 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.179488  decreased coverage  0.00096704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  37.71 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  27.44 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  35.71 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  35.32 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  35.32 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  35.32 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  33.88 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  25.75 
 
 
313 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  29.48 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  27.37 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5204  hypothetical protein  29.82 
 
 
268 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  38.96 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  27.32 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0744  hypothetical protein  23.02 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  29.66 
 
 
244 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0886  hypothetical protein  33.53 
 
 
262 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.502493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>