27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04450  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  569  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  51.53 
 
 
276 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02730  hypothetical protein  50.25 
 
 
310 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  47.27 
 
 
267 aa  135  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0454  hypothetical protein  42.11 
 
 
273 aa  126  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0585029  normal  0.661293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  47.11 
 
 
259 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  42.67 
 
 
277 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1437  putative integral membrane protein  44 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  34.7 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  34.98 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3295  putative integral membrane protein  45.83 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.179488  decreased coverage  0.00096704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5307  hypothetical protein  33.16 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5686  hypothetical protein  33.16 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5396  hypothetical protein  33.16 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.629319  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  28.75 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  29.05 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1424  hypothetical protein  22.91 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0432206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  26.5 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  28.83 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  31.08 
 
 
259 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  24.58 
 
 
263 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  33.57 
 
 
266 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  27.78 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2231  hypothetical protein  29.33 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397252  normal  0.947267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2993  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  24.75 
 
 
269 aa  42.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>