202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3021 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3021  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.735727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5062  HesB/YadR/YfhF-family protein  47.37 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.88 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0762  Fe-S cluster formation protein  47.5 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.08 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.59 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.8 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  36.14 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.5 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.49 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.27 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  36.25 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.25 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.25 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.25 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.77 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.52 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1321  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.27 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  0.902346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.93 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  41.54 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.25 
 
 		 107 aa  50.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02420  iron-sulfur cluster assembly protein  37.5 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1140  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.5 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.960309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.88 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02384  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2813  iron-sulfur cluster assembly protein  37.5 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0693876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3760  iron-sulfur cluster assembly protein  37.5 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2681  iron-sulfur cluster assembly protein  37.5 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.632645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.88 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2679  iron-sulfur cluster assembly protein  37.5 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3951  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.08 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.04 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2903  iron-sulfur cluster assembly protein  37.5 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.193347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1149  iron-sulfur cluster assembly protein  37.5 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0396578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.88 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.88 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.54 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1555  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  36.05 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0428449  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.62 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2577  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.05 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271604  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.68 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  40.98 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.91 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.9 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  35 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2803  iron-sulfur cluster assembly protein  36.25 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  37.36 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  32.56 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  37.36 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  37.36 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  37.36 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2902  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.62 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.98 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0765  HesB/YadR/YfhF  35 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.593205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.08 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.08 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.94 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2696  iron-sulfur cluster assembly protein  36.25 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2781  iron-sulfur cluster assembly protein  36.25 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2915  iron-sulfur cluster assembly protein  36.25 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4614  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.84 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.147205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  37.5 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  36.25 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  37.36 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  37.36 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  37.36 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  37.36 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01341  hypothetical protein  34.38 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  36.71 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1659  HesB/YadR/YfhF  42.11 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.26 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  36.47 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3971  Iron-sulfur cluster assembly protein  42.11 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0542987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  37.36 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1479  HesB/YadR/YfhF family protein  36.47 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0909  HesB/YadR/YfhF  44.62 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0796316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.71 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.52 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.62 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1456  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.56 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.726926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  36.05 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.47 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  37.88 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  36.05 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2161  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.63 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2034  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.23 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2740  iron-sulfur cluster assembly protein  35 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.52 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  30.23 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  33.72 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2749  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.5 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389154  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0119  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2835  HesB/YadR/YfhF  40.35 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0518728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  42.11 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  34.88 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2748  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.35 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.51933  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0344  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.94 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.29 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  43.64 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3509  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.25 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.684527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>