More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5062 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5062  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 
99 aa  204  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589222  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
115 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
116 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0762  Fe-S cluster formation protein  44.32 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3021  HesB/YadR/YfhF-family protein  47.37 
 
 
92 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.735727  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.26 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.63 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.35 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  34.09 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.82 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.04 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.74 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.23 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.23 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  35.87 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.63 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.7 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  39.02 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.63 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.63 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.63 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.63 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.63 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.58 
 
 
108 aa  57.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.96 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  29.79 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.83 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.48 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.48 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.48 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.56 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.48 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.41 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  36.67 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.96 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.35 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.41 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
118 aa  55.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2452  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.36 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.162096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.44 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.96 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.96 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.44 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.78 
 
 
110 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.07 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  40 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1567  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.98 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.679568 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  38.37 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
108 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.78 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.68 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  29.67 
 
 
124 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  29.67 
 
 
124 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1565  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.23 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  38.82 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  29.67 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0985  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  29.79 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  34.44 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  34.44 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  34.44 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  34.44 
 
 
117 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  31.18 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.56 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.82 
 
 
107 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3149  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.025262  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.79 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  34.44 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  34.44 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  34.44 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1163  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.267725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.82 
 
 
107 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  31.18 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440917  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1208  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  35.87 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.371848  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.82 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.58 
 
 
206 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>