More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0762 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0762  Fe-S cluster formation protein  100 
 
 
105 aa  216  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.55 
 
 
115 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
116 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5062  HesB/YadR/YfhF-family protein  44.32 
 
 
99 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589222  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.89 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  38.89 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.41 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.04 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.84 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  38.95 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  38.95 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.16 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.07 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.04 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  31.87 
 
 
126 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  31.87 
 
 
126 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.44 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  35.11 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  35.79 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  34.04 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.04 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.04 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.04 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  31.58 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.87 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1166  Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0148248  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.04 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  29.17 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.54 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.54 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.54 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  40.54 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.16 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  36.17 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  34.69 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.11 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2057  iron-sulfur cluster assembly protein  32.98 
 
 
107 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0583672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.7 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  34.04 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.97 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.97 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  29.67 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  34.04 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0433  iron-sulfur cluster assembly protein  37.89 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.79 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1170  iron-sulfur cluster assembly protein  37.89 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.806091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1278  iron-sulfur cluster assembly protein  37.89 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.402601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.61 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3625  iron-sulfur cluster assembly protein  36.84 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.655244  normal  0.813193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.97 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01057  hypothetical protein  34.74 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2203  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.98 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  32.97 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  30.85 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  30.77 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  30.77 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  36.59 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0719  iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  34.04 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.52 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  36.17 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  34.04 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0203  HesB/YadR/YfhF  34.88 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  31.52 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1658  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.84 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.502559  hitchhiker  0.000512708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0279  HesB/YadR/YfhF family protein  39.19 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00587382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.97 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1185  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.3 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1479  HesB/YadR/YfhF family protein  37.84 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  30.85 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.79 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2869  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.03 
 
 
107 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.586009  hitchhiker  0.0000000184682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1362  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.87 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  32.98 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0806  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00435641  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  37.33 
 
 
107 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.77 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2111  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.04 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0269889  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.03 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1301  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.98 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0512057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0832  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.26 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479879  normal  0.474138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14750  putative iron-binding protein IscA  32.98 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3025  iron-sulfur cluster assembly protein  39.73 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.116903  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1758  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.63 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0855502  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1441  HesB/YadR/YfhF, Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  32.26 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0666522  hitchhiker  0.00534365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.52 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14867  predicted protein  39.19 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.47906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.17 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1021  hypothetical protein  33.7 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31629  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.56 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2461  FeS assembly scaffold SufA  26 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44699  Iron Sulfur Assembly  31.46 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0410  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.26 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0421  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.26 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0182492  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11154  predicted protein  30 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2323  HesB/YadR/YfhF  30.77 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>