More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1758 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1758  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
150 aa  315  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0855502  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2111  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  93.48 
 
 
149 aa  271  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0269889  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.21 
 
 
148 aa  154  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.25 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.86 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.41 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.36 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.83 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.44 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
130 aa  107  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.3 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3067  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.27 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.3 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2673  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.27 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.407171  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.3 
 
 
132 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.54 
 
 
116 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
115 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.83 
 
 
126 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2494  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.95 
 
 
121 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.1 
 
 
124 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.54 
 
 
120 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  45.54 
 
 
113 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.43 
 
 
123 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.38 
 
 
122 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.67 
 
 
121 aa  103  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.43 
 
 
123 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.43 
 
 
123 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.43 
 
 
123 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.11 
 
 
118 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.74 
 
 
117 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  44.64 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.64 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.37 
 
 
116 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.18 
 
 
121 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  44.55 
 
 
117 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  40.35 
 
 
119 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.13 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  42.74 
 
 
117 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
121 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  42.74 
 
 
117 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.65 
 
 
124 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  42.74 
 
 
117 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
121 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  42.74 
 
 
117 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0323  HesB/YadR/YfhF  40 
 
 
140 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000000123552  hitchhiker  0.00657769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.13 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.65 
 
 
124 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.13 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  42.74 
 
 
130 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.75 
 
 
116 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  42.74 
 
 
130 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  42.74 
 
 
130 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  41.88 
 
 
117 aa  100  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.53 
 
 
121 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  46.61 
 
 
116 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
105 aa  100  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  41.67 
 
 
121 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.64 
 
 
124 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.64 
 
 
124 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  42.74 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.59 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.53 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.88 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  44.76 
 
 
130 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.75 
 
 
124 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.53 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.25 
 
 
121 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.76 
 
 
122 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.83 
 
 
119 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.75 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.83 
 
 
119 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.53 
 
 
121 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.24 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.75 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.96 
 
 
116 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.07 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0556  HesB/YadR/YfhF  43.24 
 
 
113 aa  96.7  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.208955  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.12 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.63 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.31 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.68 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  40.95 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2081  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.31 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.572379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  40 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>