81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2479 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1609  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  88.07 
 
 		 486 aa  868    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2645  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  98.97 
 
 		 486 aa  994    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334316  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2547  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  98.97 
 
 		 486 aa  994    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2479  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  100 
 
 		 486 aa  1003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1620  hypothetical protein  87.65 
 
 		 486 aa  863    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1505  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  87.65 
 
 		 490 aa  863    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1643  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  87.86 
 
 		 486 aa  867    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2477  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  64.68 
 
 		 482 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2734  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  87.86 
 
 		 486 aa  865    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.441431  normal  0.169047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1810  ATPase  91.77 
 
 		 485 aa  930    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2575  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  64.54 
 
 		 480 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0355186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3097  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  62.65 
 
 		 484 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25777  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2493  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  63.79 
 
 		 481 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0451147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2666  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  60.99 
 
 		 481 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.543288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1557  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  59.88 
 
 		 484 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1240  ATPase  60.49 
 
 		 473 aa  579  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0484  hypothetical protein  46.23 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1757  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.96 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3001  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  46.88 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.25 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.61398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2533  hypothetical protein  45.7 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2619  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.36 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.509235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1898  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.49 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.275408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1790  hypothetical protein  45.49 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1810  YcjX  45.21 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.369359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2154  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  44.91 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.487919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1465  YcjX  45.21 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1647  hypothetical protein  45.21 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2607  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.32 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0283898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2304  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.21 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000476158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1801  hypothetical protein  45.21 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1809  hypothetical protein  45.21 
 
 		 465 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1871  hypothetical protein  45.21 
 
 		 465 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0200876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1966  hypothetical protein  45.42 
 
 		 465 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.575033 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01309  hypothetical protein  45.21 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00070724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2327  hypothetical protein  44.91 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1436  hypothetical protein  45.21 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2325  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  45.21 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000152241  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01298  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  45.21 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00160773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3769  hypothetical protein  42.6 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01917  hypothetical protein  44.47 
 
 		 458 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1532  hypothetical protein  45 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1554  hypothetical protein  45 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0924  hypothetical protein  44.77 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003163  putative ATP-binding protein  43.01 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1231  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  44.86 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0595  ATPase  41.1 
 
 		 469 aa  365  1e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3702  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  34.65 
 
 		 489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1420  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  37.42 
 
 		 481 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2410  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.07 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3941  hypothetical protein  34.06 
 
 		 489 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00618827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0639  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  34.11 
 
 		 455 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0251795  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3519  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34 
 
 		 500 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000525714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1772  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.92 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3463  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  34.53 
 
 		 470 aa  257  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2120  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.93 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979015  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0501  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.47 
 
 		 471 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1937  YcjX-like family protein  33.97 
 
 		 470 aa  254  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0570  hypothetical protein  34.32 
 
 		 476 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2223  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  34.32 
 
 		 476 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0930099  normal  0.347375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1417  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  32.61 
 
 		 487 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1966  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.23 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2470  hypothetical protein  32.67 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1529  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.46 
 
 		 499 aa  250  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_004310  BR1034  hypothetical protein  32.19 
 
 		 486 aa  250  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.565979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6674  hypothetical protein  33.61 
 
 		 487 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4270  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  32.74 
 
 		 488 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1000  hypothetical protein  32.19 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3389  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  34.01 
 
 		 489 aa  243  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0183343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2178  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  31.67 
 
 		 491 aa  243  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424352  decreased coverage  0.00243917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3019  YcjX-like protein  33.74 
 
 		 502 aa  242  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2137  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.2 
 
 		 502 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.361768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2385  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  32.84 
 
 		 465 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  31.88 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2119  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.09 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1783  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  31.88 
 
 		 482 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4117  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  31.82 
 
 		 484 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.038958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6216  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.89 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.940884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7088  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.82 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1175  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  28.07 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00138  hypothetical protein  23.11 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>