81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2470 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2470  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  985    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1417  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  64.27 
 
 		 487 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1034  hypothetical protein  64.54 
 
 		 486 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.565979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2120  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  65.43 
 
 		 486 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1529  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  70.14 
 
 		 499 aa  715    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1966  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  76.83 
 
 		 491 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2178  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  77.24 
 
 		 491 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424352  decreased coverage  0.00243917 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1000  hypothetical protein  64.33 
 
 		 486 aa  632  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6674  hypothetical protein  54.38 
 
 		 487 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4270  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  52.74 
 
 		 488 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3019  YcjX-like protein  53.74 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3389  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  52.23 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0183343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1772  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  52.12 
 
 		 489 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3702  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  51.42 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3941  hypothetical protein  51.21 
 
 		 489 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00618827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4117  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  54.88 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.038958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2410  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  50.7 
 
 		 493 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3519  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  52.41 
 
 		 500 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000525714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1783  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  50 
 
 		 482 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2119  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  49.8 
 
 		 482 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7088  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  51.44 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6216  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  51.02 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.940884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  49.8 
 
 		 482 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2137  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  48.74 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.361768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3463  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  46.96 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2385  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  46.77 
 
 		 465 aa  353  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0639  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  46.35 
 
 		 455 aa  348  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0251795  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1937  YcjX-like family protein  42.48 
 
 		 470 aa  346  6e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0501  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  44.37 
 
 		 471 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0570  hypothetical protein  44.37 
 
 		 476 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2223  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  44.37 
 
 		 476 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0930099  normal  0.347375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1810  YcjX  39.19 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.369359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1465  YcjX  39.19 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1647  hypothetical protein  39.19 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1809  hypothetical protein  39.19 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109841 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2533  hypothetical protein  39.23 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2619  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  39.02 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.509235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1871  hypothetical protein  38.98 
 
 		 465 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0200876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1898  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  39.02 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.275408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1790  hypothetical protein  39.02 
 
 		 465 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  39.66 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.61398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1436  hypothetical protein  38.98 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1966  hypothetical protein  38.98 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.575033 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2304  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  38.98 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000476158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3769  hypothetical protein  37.45 
 
 		 491 aa  306  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01309  hypothetical protein  38.77 
 
 		 465 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00070724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1757  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  38.51 
 
 		 471 aa  306  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01298  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  38.77 
 
 		 465 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00160773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1554  hypothetical protein  38.56 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2325  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  38.77 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1801  hypothetical protein  38.56 
 
 		 465 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1532  hypothetical protein  38.56 
 
 		 465 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2154  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  37.27 
 
 		 467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.487919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01917  hypothetical protein  39.01 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2327  hypothetical protein  37.53 
 
 		 465 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2607  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  37.29 
 
 		 465 aa  300  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0283898  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0484  hypothetical protein  37.58 
 
 		 465 aa  296  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0924  hypothetical protein  37.15 
 
 		 457 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003163  putative ATP-binding protein  37.28 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1420  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  35.92 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1231  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  38.43 
 
 		 463 aa  286  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2666  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.88 
 
 		 481 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.543288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3001  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  36.32 
 
 		 474 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2493  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  34.32 
 
 		 481 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0451147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1557  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.47 
 
 		 484 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3097  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.88 
 
 		 484 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25777  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0595  ATPase  35.11 
 
 		 469 aa  260  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1810  ATPase  33.33 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2547  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.13 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1240  ATPase  34.29 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1505  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  35.06 
 
 		 490 aa  251  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2479  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  32.67 
 
 		 486 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2645  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  32.67 
 
 		 486 aa  251  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334316  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1643  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.74 
 
 		 486 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2734  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.74 
 
 		 486 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.441431  normal  0.169047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1620  hypothetical protein  34.34 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1609  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.34 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2575  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.33 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0355186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2477  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  32.57 
 
 		 482 aa  229  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1175  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.2 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00138  hypothetical protein  25.5 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>