81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2477 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2479  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  64.68 
 
 		 486 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2547  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  64.48 
 
 		 486 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1810  ATPase  64.61 
 
 		 485 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2575  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  70.12 
 
 		 480 aa  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0355186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2645  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  64.68 
 
 		 486 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334316  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2477  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  100 
 
 		 482 aa  997    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1620  hypothetical protein  66.32 
 
 		 486 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1643  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  65.71 
 
 		 486 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1609  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  65.5 
 
 		 486 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1505  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  66.32 
 
 		 490 aa  630  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2734  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  66.12 
 
 		 486 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.441431  normal  0.169047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2493  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  62.73 
 
 		 481 aa  611  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0451147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2666  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  59.75 
 
 		 481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.543288  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1557  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  59.96 
 
 		 484 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3097  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  58.85 
 
 		 484 aa  579  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25777  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1240  ATPase  58.61 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0484  hypothetical protein  45.7 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0924  hypothetical protein  45.36 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2607  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  42.98 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0283898  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0595  ATPase  43.49 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2619  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  42.11 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.509235 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01917  hypothetical protein  44.94 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1790  hypothetical protein  42.35 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2327  hypothetical protein  42.56 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1757  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  42.47 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  43.19 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.61398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2533  hypothetical protein  42.35 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1898  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  42.35 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.275408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3769  hypothetical protein  41.02 
 
 		 491 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2154  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  42.65 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.487919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3001  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  43.1 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1231  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  44.73 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2325  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  41.3 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2304  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  41.3 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000476158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01309  hypothetical protein  41.3 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00070724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1801  hypothetical protein  41.09 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1966  hypothetical protein  41.3 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.575033 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1647  hypothetical protein  41.47 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1465  YcjX  41.47 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1809  hypothetical protein  41.47 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1871  hypothetical protein  41.68 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0200876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1810  YcjX  41.47 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.369359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1436  hypothetical protein  41.3 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01298  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  41.3 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00160773  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003163  putative ATP-binding protein  43.79 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1532  hypothetical protein  41.09 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1554  hypothetical protein  41.09 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1420  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  34.76 
 
 		 481 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2410  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.47 
 
 		 493 aa  251  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3702  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  33.61 
 
 		 489 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3941  hypothetical protein  33.4 
 
 		 489 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00618827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1772  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.03 
 
 		 489 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3519  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.91 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000525714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0639  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  32.69 
 
 		 455 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0251795  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_004310  BR1034  hypothetical protein  32.14 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.565979  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1000  hypothetical protein  32.14 
 
 		 486 aa  237  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2223  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.12 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0930099  normal  0.347375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2120  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.42 
 
 		 486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979015  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0570  hypothetical protein  33.12 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1417  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  32.98 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0501  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  32.69 
 
 		 471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1937  YcjX-like family protein  33.06 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4117  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  34.1 
 
 		 484 aa  232  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.038958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2178  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.68 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424352  decreased coverage  0.00243917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4270  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  32.85 
 
 		 488 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6674  hypothetical protein  32.78 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1966  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.57 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3463  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  33.76 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3019  YcjX-like protein  32.99 
 
 		 502 aa  229  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2470  hypothetical protein  32.57 
 
 		 489 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3389  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  33.54 
 
 		 489 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0183343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1529  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.17 
 
 		 499 aa  226  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2385  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  32.9 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2137  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  30.55 
 
 		 502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.361768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  30.61 
 
 		 482 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7088  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.93 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6216  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.48 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.940884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1783  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  30.43 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2119  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  30 
 
 		 482 aa  207  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1175  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  28.87 
 
 		 443 aa  162  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00138  hypothetical protein  23.53 
 
 		 479 aa  126  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>