81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2137 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6216  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  80.21 
 
 
481 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.940884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2119  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  82.25 
 
 
482 aa  724    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2137  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  100 
 
 
502 aa  978    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.361768 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1783  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  82.46 
 
 
482 aa  725    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7088  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  80.76 
 
 
481 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  83.51 
 
 
482 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862269  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1772  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  52.64 
 
 
489 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3019  YcjX-like protein  51.95 
 
 
502 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6674  hypothetical protein  53.43 
 
 
487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2410  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  50.72 
 
 
493 aa  450  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3702  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  51.42 
 
 
489 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3941  hypothetical protein  51.84 
 
 
489 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00618827  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3389  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  53.32 
 
 
489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0183343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2120  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  50.43 
 
 
486 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3519  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  51.43 
 
 
500 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000525714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4270  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  51.28 
 
 
488 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_004310  BR1034  hypothetical protein  51.19 
 
 
486 aa  438  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.565979  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1000  hypothetical protein  50.97 
 
 
486 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1417  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  49.24 
 
 
487 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2178  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  49.47 
 
 
491 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424352  decreased coverage  0.00243917 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2470  hypothetical protein  48.74 
 
 
489 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1966  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  51.07 
 
 
491 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1529  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  49.58 
 
 
499 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4117  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  53.85 
 
 
484 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.038958  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3463  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  43.45 
 
 
470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553743  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0501  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  43.1 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0639  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  43.38 
 
 
455 aa  302  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0251795  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0570  hypothetical protein  42.55 
 
 
476 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2223  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  42.55 
 
 
476 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0930099  normal  0.347375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2385  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  43.78 
 
 
465 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1937  YcjX-like family protein  42.29 
 
 
470 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2619  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  38.92 
 
 
465 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.509235 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2607  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  37.82 
 
 
465 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0283898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2327  hypothetical protein  37.82 
 
 
465 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1647  hypothetical protein  37.42 
 
 
465 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1810  YcjX  37.42 
 
 
465 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.369359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1465  YcjX  37.42 
 
 
465 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1871  hypothetical protein  37.42 
 
 
465 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0200876 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1809  hypothetical protein  37.42 
 
 
465 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109841 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0484  hypothetical protein  34.54 
 
 
465 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1790  hypothetical protein  37.55 
 
 
465 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2154  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  36.7 
 
 
467 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.487919  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1898  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  37.55 
 
 
465 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.275408  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2533  hypothetical protein  37.55 
 
 
465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1966  hypothetical protein  36.99 
 
 
465 aa  274  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.575033 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1757  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  37.42 
 
 
471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1801  hypothetical protein  36.77 
 
 
465 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0924  hypothetical protein  35.15 
 
 
457 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1554  hypothetical protein  36.56 
 
 
465 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01298  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  36.77 
 
 
465 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00160773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2304  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.77 
 
 
465 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000476158  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1532  hypothetical protein  36.56 
 
 
465 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1436  hypothetical protein  36.77 
 
 
465 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01309  hypothetical protein  36.77 
 
 
465 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00070724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3769  hypothetical protein  34.89 
 
 
491 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2325  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.56 
 
 
465 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  37.58 
 
 
469 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.61398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2493  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.4 
 
 
481 aa  261  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0451147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1420  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  35.28 
 
 
481 aa  259  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1231  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  40 
 
 
463 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3001  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  35.27 
 
 
474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1557  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  30.91 
 
 
484 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3097  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  31.85 
 
 
484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25777  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003163  putative ATP-binding protein  34.63 
 
 
458 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01917  hypothetical protein  34.49 
 
 
458 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2666  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.34 
 
 
481 aa  249  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.543288  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2479  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.2 
 
 
486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2645  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.2 
 
 
486 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334316  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0595  ATPase  32.13 
 
 
469 aa  244  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1240  ATPase  33.13 
 
 
473 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2547  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  32.99 
 
 
486 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1505  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  34.52 
 
 
490 aa  240  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1810  ATPase  33.06 
 
 
485 aa  239  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1643  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.4 
 
 
486 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1609  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.4 
 
 
486 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2734  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.2 
 
 
486 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.441431  normal  0.169047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1620  hypothetical protein  32.85 
 
 
486 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2575  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  30.92 
 
 
480 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0355186  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_2477  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  30.55 
 
 
482 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1175  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  28.39 
 
 
443 aa  160  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00138  hypothetical protein  23.12 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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