81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4270 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3389  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  77.3 
 
 		 489 aa  780    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0183343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1772  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  81.19 
 
 		 489 aa  811    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3702  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  82.41 
 
 		 489 aa  823    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3019  YcjX-like protein  77.51 
 
 		 502 aa  786    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6674  hypothetical protein  75.05 
 
 		 487 aa  759    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3941  hypothetical protein  81.6 
 
 		 489 aa  814    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00618827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4270  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  100 
 
 		 488 aa  987    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2410  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  56.69 
 
 		 493 aa  542  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4117  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  61.65 
 
 		 484 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.038958  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1034  hypothetical protein  56.33 
 
 		 486 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.565979  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1000  hypothetical protein  56.12 
 
 		 486 aa  525  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2120  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  55.51 
 
 		 486 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1966  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  55.22 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1529  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  55.71 
 
 		 499 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2178  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  53.94 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.424352  decreased coverage  0.00243917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1417  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  55.92 
 
 		 487 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2470  hypothetical protein  52.74 
 
 		 489 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3519  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  55.36 
 
 		 500 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000525714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2137  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  51.28 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.361768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7088  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  53.89 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6216  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  53.06 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.940884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2119  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  51.07 
 
 		 482 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.710433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1783  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  51.07 
 
 		 482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.428628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  50.21 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0862269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0501  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  45.45 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3463  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  46.3 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2223  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  45.68 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0930099  normal  0.347375 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0570  hypothetical protein  45.68 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67906  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1937  YcjX-like family protein  43.55 
 
 		 470 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0639  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  43.46 
 
 		 455 aa  323  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0251795  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2385  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  44.68 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3769  hypothetical protein  37.01 
 
 		 491 aa  313  4.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1757  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  37.61 
 
 		 471 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1790  hypothetical protein  37.61 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1898  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  37.61 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.275408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0924  hypothetical protein  37.02 
 
 		 457 aa  293  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2533  hypothetical protein  37.61 
 
 		 465 aa  292  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2154  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  37.18 
 
 		 467 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.487919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1810  YcjX  37.34 
 
 		 465 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.369359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1465  YcjX  37.34 
 
 		 465 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1647  hypothetical protein  37.34 
 
 		 465 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1871  hypothetical protein  37.34 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0200876 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1809  hypothetical protein  37.34 
 
 		 465 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1725  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  37.47 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.61398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1966  hypothetical protein  37.34 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.575033 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1801  hypothetical protein  37.13 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2619  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.76 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.509235 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003163  putative ATP-binding protein  35.36 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01917  hypothetical protein  35.83 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2607  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  35.44 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0283898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1532  hypothetical protein  37.13 
 
 		 465 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1436  hypothetical protein  36.71 
 
 		 465 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2304  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.71 
 
 		 465 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000476158  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2325  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.71 
 
 		 465 aa  282  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1554  hypothetical protein  36.92 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01298  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  36.92 
 
 		 465 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00160773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01309  hypothetical protein  36.92 
 
 		 465 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00070724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2327  hypothetical protein  35.44 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1420  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  36.11 
 
 		 481 aa  279  9e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1557  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.26 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2493  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  35.6 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0451147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1231  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  39.79 
 
 		 463 aa  277  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3097  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  36.16 
 
 		 484 aa  276  8e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25777  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0484  hypothetical protein  33.76 
 
 		 465 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2666  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  31.81 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.543288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0595  ATPase  33.12 
 
 		 469 aa  263  4.999999999999999e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2575  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  35.33 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0355186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1240  ATPase  36.4 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3001  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  33.8 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1810  ATPase  32.78 
 
 		 485 aa  249  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2479  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  32.74 
 
 		 486 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2547  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  32.74 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2645  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  32.74 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.334316  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1505  protein of unknown function DUF463, YcjX family protein  33.4 
 
 		 490 aa  239  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1620  hypothetical protein  33.4 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.726453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1643  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.2 
 
 		 486 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2734  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  33.2 
 
 		 486 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.441431  normal  0.169047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1609  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  32.65 
 
 		 486 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2477  protein of unknown function DUF463, YcjX-like protein  32.85 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1175  protein of unknown function DUF463 YcjX family protein  31.22 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00138  hypothetical protein  24.37 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>