41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1894 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1328    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  31.87 
 
 		 537 aa  258  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  32.14 
 
 		 537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  30.94 
 
 		 600 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  31.51 
 
 		 547 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  30.38 
 
 		 576 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  30.45 
 
 		 567 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  29.55 
 
 		 550 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  28.83 
 
 		 552 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  29.31 
 
 		 549 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  29.55 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  29.62 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  27.66 
 
 		 561 aa  190  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  27.9 
 
 		 566 aa  190  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  28.87 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  29.82 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  29.38 
 
 		 549 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  27.33 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  27.74 
 
 		 561 aa  177  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  28.44 
 
 		 636 aa  177  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  29.37 
 
 		 564 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  28.66 
 
 		 564 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  28.71 
 
 		 564 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  28.93 
 
 		 558 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  27.26 
 
 		 578 aa  173  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  28.99 
 
 		 571 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  27.55 
 
 		 623 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  27.36 
 
 		 576 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  27.33 
 
 		 578 aa  171  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  26.56 
 
 		 564 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  26.56 
 
 		 564 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  27.27 
 
 		 564 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  27.5 
 
 		 564 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  27.33 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  27 
 
 		 564 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  33.2 
 
 		 579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  24.76 
 
 		 720 aa  107  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.37 
 
 		 715 aa  83.2  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 988 aa  82.4  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06678  conserved hypothetical protein  28.31 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.247886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.94 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>