41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2838 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  100 
 
 		 549 aa  1100    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  97.63 
 
 		 549 aa  1011    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  91.44 
 
 		 549 aa  974    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  80.66 
 
 		 549 aa  883    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  55.21 
 
 		 550 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  57.25 
 
 		 549 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  57.38 
 
 		 558 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  53.11 
 
 		 576 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  51.74 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  51.75 
 
 		 547 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  50.27 
 
 		 636 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  49.17 
 
 		 564 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  49.17 
 
 		 564 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  49.26 
 
 		 576 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  49.54 
 
 		 564 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  50.54 
 
 		 623 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  49.44 
 
 		 564 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  49.26 
 
 		 564 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  50.64 
 
 		 552 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  50.37 
 
 		 567 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  49.63 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  51.63 
 
 		 579 aa  485  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  50.27 
 
 		 571 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  48.89 
 
 		 564 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  48.52 
 
 		 564 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  48.33 
 
 		 564 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  49.46 
 
 		 558 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  47.71 
 
 		 561 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  47.52 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  43.83 
 
 		 566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  33.27 
 
 		 537 aa  258  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  32.6 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  29.66 
 
 		 643 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  32.15 
 
 		 600 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  28.7 
 
 		 578 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  26.34 
 
 		 578 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  27.27 
 
 		 720 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  32.83 
 
 		 988 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.16 
 
 		 715 aa  90.9  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.96 
 
 		 769 aa  61.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06678  conserved hypothetical protein  26.39 
 
 		 789 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.247886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>