40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0014 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1147    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  45.39 
 
 
552 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  44.92 
 
 
549 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  44.5 
 
 
549 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  45.12 
 
 
558 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  45.89 
 
 
567 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  45.81 
 
 
579 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  44.74 
 
 
636 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  42.93 
 
 
549 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  44.29 
 
 
576 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  45.21 
 
 
623 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  42.99 
 
 
550 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  44.37 
 
 
564 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  43.11 
 
 
567 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  43.33 
 
 
564 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  43.57 
 
 
566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  43.33 
 
 
564 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  43.56 
 
 
564 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  43.27 
 
 
549 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  44.12 
 
 
564 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  43.75 
 
 
564 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  43.75 
 
 
564 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  43.16 
 
 
564 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  44.72 
 
 
571 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  42.01 
 
 
576 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  44.96 
 
 
547 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  43.65 
 
 
549 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  43.86 
 
 
558 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  43.24 
 
 
561 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  42.53 
 
 
561 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  31.16 
 
 
537 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  31.58 
 
 
537 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  31.28 
 
 
600 aa  207  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  28.06 
 
 
643 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  24.56 
 
 
578 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  26.25 
 
 
578 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 
988 aa  99.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  23.53 
 
 
720 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.25 
 
 
715 aa  77.4  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.64 
 
 
769 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>