41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1551 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  70.83 
 
 
567 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  91.2 
 
 
564 aa  966    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  91.38 
 
 
564 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  69.13 
 
 
576 aa  737    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  64.79 
 
 
571 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  68.74 
 
 
564 aa  752    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  68.56 
 
 
564 aa  740    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  68.03 
 
 
564 aa  735    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  66.49 
 
 
636 aa  698    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  68.74 
 
 
564 aa  752    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  64.83 
 
 
623 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  100 
 
 
566 aa  1118    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  66.79 
 
 
564 aa  722    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  91.74 
 
 
564 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  51.59 
 
 
576 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  51.75 
 
 
567 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  57.53 
 
 
558 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  54.26 
 
 
549 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  53.26 
 
 
550 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  54.58 
 
 
558 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  51.11 
 
 
549 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  54.43 
 
 
561 aa  514  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  53.36 
 
 
552 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  54.26 
 
 
561 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  49.82 
 
 
547 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  48.89 
 
 
549 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  49.45 
 
 
549 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  53.91 
 
 
579 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  49.63 
 
 
549 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  43.75 
 
 
566 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  32.18 
 
 
537 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  31.38 
 
 
537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  32.39 
 
 
600 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  28.73 
 
 
643 aa  193  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  27.65 
 
 
578 aa  188  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  28.4 
 
 
578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  26.3 
 
 
720 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 
988 aa  89  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  21.52 
 
 
715 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06678  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 
789 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.247886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 
769 aa  50.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>