41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1667 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  100 
 
 		 600 aa  1220    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  30.94 
 
 		 643 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  32.5 
 
 		 576 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  30 
 
 		 537 aa  236  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  31.31 
 
 		 567 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  32.32 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  32.05 
 
 		 564 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  32.05 
 
 		 564 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  28.42 
 
 		 537 aa  217  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  32.39 
 
 		 566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  31.13 
 
 		 564 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  31.88 
 
 		 564 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  30.96 
 
 		 564 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  32.2 
 
 		 558 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  31.59 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  31.24 
 
 		 549 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  30.74 
 
 		 552 aa  210  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  30.96 
 
 		 564 aa  210  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  31.28 
 
 		 566 aa  209  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  31.88 
 
 		 564 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  32.14 
 
 		 547 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  31.64 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  31.65 
 
 		 549 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  30.59 
 
 		 550 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  31.27 
 
 		 571 aa  203  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  31.1 
 
 		 576 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  32.88 
 
 		 558 aa  198  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  30.94 
 
 		 579 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  31.85 
 
 		 636 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  27.75 
 
 		 578 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  30.94 
 
 		 623 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  30.88 
 
 		 564 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  31.07 
 
 		 561 aa  191  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  31.23 
 
 		 567 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  29.22 
 
 		 578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  31.12 
 
 		 561 aa  182  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  32.81 
 
 		 988 aa  99  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  24.53 
 
 		 720 aa  97.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.07 
 
 		 715 aa  70.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06678  conserved hypothetical protein  26.49 
 
 		 789 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.247886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.65 
 
 		 769 aa  60.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>