41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1185 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  71.09 
 
 		 567 aa  741    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  99.29 
 
 		 564 aa  1107    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1116    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  68.81 
 
 		 576 aa  728    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  64.26 
 
 		 571 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  69.05 
 
 		 564 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  68.87 
 
 		 564 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  68.6 
 
 		 564 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  65.9 
 
 		 636 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  69.05 
 
 		 564 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  64.29 
 
 		 623 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  91.17 
 
 		 566 aa  999    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  67.08 
 
 		 564 aa  729    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  99.65 
 
 		 564 aa  1110    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  57.32 
 
 		 558 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  51.29 
 
 		 576 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  50.9 
 
 		 567 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  53.37 
 
 		 549 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  52.28 
 
 		 550 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  54.1 
 
 		 558 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  50 
 
 		 549 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  54.09 
 
 		 561 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  52.64 
 
 		 552 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  54.09 
 
 		 561 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  49.82 
 
 		 547 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  47.59 
 
 		 549 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  52.41 
 
 		 579 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  48.52 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  48.52 
 
 		 549 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  43.75 
 
 		 566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  32.03 
 
 		 537 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  31.49 
 
 		 537 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  31.09 
 
 		 600 aa  204  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  28.94 
 
 		 643 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  27.29 
 
 		 578 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  27.26 
 
 		 578 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  26.36 
 
 		 720 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.04 
 
 		 715 aa  91.3  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  29.71 
 
 		 988 aa  82  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.37 
 
 		 769 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06678  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 789 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.247886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>