40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1497 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1158    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  56.23 
 
 
549 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  55.86 
 
 
558 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  52.19 
 
 
576 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  52.82 
 
 
567 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  53.61 
 
 
547 aa  535  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  52.73 
 
 
549 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  54.18 
 
 
552 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  50.97 
 
 
550 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  53.91 
 
 
566 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  51.89 
 
 
564 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  51.89 
 
 
564 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  51.09 
 
 
549 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  51.07 
 
 
576 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  53.24 
 
 
567 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  51.71 
 
 
564 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  52.82 
 
 
564 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  52.82 
 
 
564 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  51.89 
 
 
564 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  51.53 
 
 
564 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  52.82 
 
 
564 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  51.79 
 
 
636 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  50.35 
 
 
623 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  51.72 
 
 
549 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  51.27 
 
 
549 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  51.87 
 
 
571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  49.91 
 
 
558 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  50 
 
 
561 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  45.81 
 
 
566 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  50.27 
 
 
561 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  33.64 
 
 
537 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  33.64 
 
 
537 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  30.94 
 
 
600 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  29.19 
 
 
643 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  29.55 
 
 
578 aa  187  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  26.74 
 
 
578 aa  163  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  26.92 
 
 
720 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 
988 aa  95.9  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  22 
 
 
715 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.18 
 
 
769 aa  54.3  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>