41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3424 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  100 
 
 
549 aa  1093    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  59.82 
 
 
576 aa  634    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  92.34 
 
 
558 aa  980    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  60.11 
 
 
567 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  56.88 
 
 
550 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  56.33 
 
 
549 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  56.7 
 
 
549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  54.53 
 
 
564 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  54.53 
 
 
564 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  56.38 
 
 
552 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  56.88 
 
 
549 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  57.25 
 
 
549 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  54.71 
 
 
564 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  54.26 
 
 
566 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  54.2 
 
 
564 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  52.55 
 
 
636 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  53.45 
 
 
576 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  53.11 
 
 
623 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  53.47 
 
 
564 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  55.78 
 
 
547 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  53.96 
 
 
564 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  55.56 
 
 
567 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  55.56 
 
 
571 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  53.78 
 
 
564 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  53.83 
 
 
558 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  53.59 
 
 
564 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  56.23 
 
 
579 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  50.27 
 
 
561 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  49.82 
 
 
561 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  44.5 
 
 
566 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  34.18 
 
 
537 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  33.03 
 
 
537 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  32.32 
 
 
600 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  29.62 
 
 
643 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  29.51 
 
 
578 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  25.3 
 
 
578 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  27.51 
 
 
720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  33.68 
 
 
988 aa  94  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.87 
 
 
715 aa  80.9  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.88 
 
 
769 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06678  conserved hypothetical protein  28.39 
 
 
789 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.247886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>