41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06099 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  74.63 
 
 		 537 aa  822    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1102    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  33.03 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  32.9 
 
 		 549 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 547 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  32.9 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  32.14 
 
 		 643 aa  259  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  32.36 
 
 		 550 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  33.09 
 
 		 549 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  33.03 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  33.64 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  31.62 
 
 		 552 aa  253  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  31.38 
 
 		 566 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  32.12 
 
 		 576 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  31.72 
 
 		 567 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  31.16 
 
 		 566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  32.36 
 
 		 558 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  31.07 
 
 		 564 aa  243  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  31.12 
 
 		 564 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  31.12 
 
 		 564 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  30.47 
 
 		 558 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  29.83 
 
 		 576 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  29.67 
 
 		 564 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  30.27 
 
 		 564 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  30.27 
 
 		 564 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  30.98 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  30.11 
 
 		 623 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  30.45 
 
 		 561 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  29.17 
 
 		 564 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  29.71 
 
 		 564 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  29.57 
 
 		 636 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  30.45 
 
 		 561 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  28.94 
 
 		 600 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  30.83 
 
 		 567 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  27.35 
 
 		 578 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  25.5 
 
 		 578 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  23.85 
 
 		 720 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 		 988 aa  92.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  20.92 
 
 		 769 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.55 
 
 		 715 aa  81.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06678  conserved hypothetical protein  25.33 
 
 		 789 aa  63.9  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.247886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>