41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2944 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2838  VRR-NUC domain protein  91.44 
 
 		 549 aa  950    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.717913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2851  VRR-NUC domain-containing protein  91.8 
 
 		 549 aa  960    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2944  VRR-NUC domain-containing protein  100 
 
 		 549 aa  1095    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2973  VRR-NUC domain-containing protein  81.57 
 
 		 549 aa  894    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0976704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3424  hypothetical protein  56.7 
 
 		 549 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2689  hypothetical protein  53.75 
 
 		 550 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40370  hypothetical protein  56.83 
 
 		 558 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3272  hypothetical protein  52.2 
 
 		 576 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.2996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3109  hypothetical protein  51.55 
 
 		 567 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.303586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4110  hypothetical protein  51.75 
 
 		 547 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.535976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5422  VRR-NUC domain protein  49.19 
 
 		 636 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23850  hypothetical protein  51.2 
 
 		 552 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3979  hypothetical protein  48.24 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4388  hypothetical protein  48.24 
 
 		 564 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1179  hypothetical protein  49.64 
 
 		 623 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0552021  normal  0.727006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1551  Uvs005  48.89 
 
 		 566 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.629775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1497  hypothetical protein  51.09 
 
 		 579 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4267  VRR-NUC domain-containing protein  47.71 
 
 		 576 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0413934  normal  0.150321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5967  VRR-NUC domain-containing protein  48.61 
 
 		 564 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0168083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3800  hypothetical protein  47.96 
 
 		 564 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.615241  normal  0.813923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5308  VRR-NUC domain-containing protein  49.91 
 
 		 571 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10237  normal  0.0119599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4234  VRR-NUC domain-containing protein  49.07 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1631  hypothetical protein  47.96 
 
 		 564 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5814  VRR-NUC domain-containing protein  49.28 
 
 		 558 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89064  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1185  hypothetical protein  47.59 
 
 		 564 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1259  hypothetical protein  47.96 
 
 		 564 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2453  Uvs005  47.41 
 
 		 564 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1415  VRR-NUC domain protein  46.79 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2429  hypothetical protein  46.42 
 
 		 561 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.308662  normal  0.357068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0014  hypothetical protein  42.93 
 
 		 566 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06099  hypothetical protein  32.9 
 
 		 537 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000298  hypothetical protein  32.6 
 
 		 537 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000232671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1667  hypothetical protein  31.76 
 
 		 600 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000108277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1894  hypothetical protein  29.55 
 
 		 643 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.278256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3132  VRR-NUC domain protein  29.34 
 
 		 578 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2701  VRR-NUC domain protein  26.12 
 
 		 578 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  27.45 
 
 		 720 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02280  conserved hypothetical protein  31.47 
 
 		 988 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03930  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.78 
 
 		 715 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2348  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.41 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.574239  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06678  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 		 789 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.247886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>