229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0693 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0693  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 179 aa  349  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0696198  normal  0.127411 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  62.75 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  58.46 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  56.92 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  54.1 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.21 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.46 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.32 
 
 		 106 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  54.9 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.06 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.62 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.06 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  37.5 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.98 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.59 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  44.78 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  29.38 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.39 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.78 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.17 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.17 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.27 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.27 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1574  sec-independent translocase  25.9 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  32.63 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.27 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.4 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  35.29 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2010  sec-independent translocase  35.71 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.42 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.29 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  43.06 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  29.91 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  29.19 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  29.19 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  29.19 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  29.19 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  29.19 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  36.23 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  56.82 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  51.11 
 
 		 57 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3518  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 		 108 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000524898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3587  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.11 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31.78 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.88 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.81 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.85 
 
 		 92 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  54.76 
 
 		 60 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  31.97 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  52.38 
 
 		 56 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.4 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.39 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  34.21 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  26.51 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1093  sec-independent translocase  32 
 
 		 148 aa  52.4  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  41.51 
 
 		 91 aa  51.6  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  39.62 
 
 		 104 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  29.58 
 
 		 139 aa  51.6  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  51.92 
 
 		 155 aa  51.6  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  28.11 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  35.62 
 
 		 168 aa  51.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.98 
 
 		 145 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  32.71 
 
 		 125 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  34.25 
 
 		 165 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  34.57 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  39.62 
 
 		 91 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  29.29 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.46 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  27.2 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  39.62 
 
 		 91 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  28.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  28.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  48.89 
 
 		 60 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  30.14 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  51.28 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  30.14 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  30.14 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  28.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  28.18 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  34.62 
 
 		 96 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  28.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  28.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  30.14 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  28.95 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  31.91 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  29.01 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  26.77 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0908  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.37 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305104  normal  0.113813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  34.21 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  32.14 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  34.62 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  28.11 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  30.14 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  30.14 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.8 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  34.62 
 
 		 88 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>