More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0034 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0154  23S ribosomal RNA  89.43 
 
 		 2781 bp  1752    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0039  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2911 bp  5771    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2338  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 		 2888 bp  2864    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0052  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2911 bp  5771    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r02  23S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 3163 bp  1933    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2341  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 		 2888 bp  2864    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1264  23S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 3084 bp  1608    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1520  23S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 3084 bp  1608    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.614168  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SA  23S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 3063 bp  1590    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SB  23S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 3063 bp  1590    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SC  23S ribosomal RNA  90.48 
 
 		 3063 bp  1590    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0034  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2911 bp  5771    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1462  23S ribosomal RNA  87.44 
 
 		 2891 bp  2722    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1727  23S ribosomal RNA  91.54 
 
 		 2796 bp  1471    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0463  23S ribosomal RNA  87.44 
 
 		 2891 bp  2722    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.815626  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r05  23S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 3163 bp  1933    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1804  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2894 bp  2272    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1801  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2894 bp  2272    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.267192  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1798  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2894 bp  2272    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0040  23S ribosomal RNA  90.7 
 
 		 3045 bp  1608    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.339342  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2337  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 		 2888 bp  2864    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.49451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r03  23S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 3163 bp  1933    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0508  23S ribosomal RNA  89.43 
 
 		 2781 bp  1752    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0295614  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1707  23S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 2794 bp  1463    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0520  23S ribosomal RNA  87.44 
 
 		 2891 bp  2722    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0594  23S ribosomal RNA  89.43 
 
 		 2781 bp  1752    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1714  23S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 2795 bp  1455    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0020  23S ribosomal RNA  90 
 
 		 2884 bp  1419    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0024  23S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 2885 bp  1411    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0033  23S ribosomal RNA  90 
 
 		 2884 bp  1419    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0057  23S ribosomal RNA  90 
 
 		 2884 bp  1419    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.389269  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0097  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0092  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.539989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0098  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3469  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4291  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.329692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4191  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18825  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4195  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00174928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4206  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000822099  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0471  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0095  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0096  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0094  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0130  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162326  normal  0.132497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4283  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00262409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0093  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644352  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3399  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0629  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000293702  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1922  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.264336  normal  0.836086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4245  23S ribosomal RNA  83.67 
 
 		 2907 bp  622  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.038197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0014  23S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 2872 bp  620  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0042  23S ribosomal RNA  88.75 
 
 		 2872 bp  620  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121457 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2804  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2889 bp  618  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0566286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2072  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2887 bp  618  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.470715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0245  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2889 bp  618  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.155375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2335  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2889 bp  618  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000128032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2326  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2889 bp  618  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2711  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2889 bp  618  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0116146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2546  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2889 bp  618  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.484433  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2457  23S ribosomal RNA  83.03 
 
 		 2889 bp  618  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4217  23S ribosomal RNA  83.57 
 
 		 2907 bp  615  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0018  23S ribosomal RNA  87.85 
 
 		 2988 bp  579  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0119  23S ribosomal RNA  87.86 
 
 		 2895 bp  571  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0022  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 2893 bp  561  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0017  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2895 bp  563  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000617374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_r002  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r005  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r008  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2894 bp  563  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r011  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r014  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r017  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r020  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r023  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r026  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0122  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 2893 bp  561  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0112  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 2893 bp  561  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0002  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 2893 bp  561  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.959463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0129  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 2893 bp  561  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0072  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2895 bp  563  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.130821  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0010  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2895 bp  563  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0133  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2895 bp  563  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00116115  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0142  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2896 bp  563  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0129  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2895 bp  563  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332932 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0143  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2894 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0140  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0122  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.969635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0002  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.492003  hitchhiker  0.00473622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0010  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150973  normal  0.511936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0017  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000288824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0074  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0122  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.750631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0131  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.595604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0135  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  hitchhiker  0.00197416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0139  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.746885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0142  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.080759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0002  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0010  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0173103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0017  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0023  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00167736  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0027  23S ribosomal RNA  87.68 
 
 		 2893 bp  563  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.206108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>