More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0040 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_r05  23S ribosomal RNA  91.67 
 
 
3163 bp  2111    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r03  23S ribosomal RNA  91.67 
 
 
3163 bp  2111    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SA  23S ribosomal RNA  98.85 
 
 
3063 bp  5783    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SB  23S ribosomal RNA  98.85 
 
 
3063 bp  5783    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SC  23S ribosomal RNA  98.85 
 
 
3063 bp  5783    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1798  23S ribosomal RNA  92.01 
 
 
2894 bp  1737    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1462  23S ribosomal RNA  98.35 
 
 
2891 bp  3146    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1804  23S ribosomal RNA  92.01 
 
 
2894 bp  1737    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0052  23S ribosomal RNA  90.7 
 
 
2911 bp  1608    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0040  23S ribosomal RNA  100 
 
 
3045 bp  6036    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.339342  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1801  23S ribosomal RNA  92.01 
 
 
2894 bp  1737    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.267192  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0463  23S ribosomal RNA  98.35 
 
 
2891 bp  3146    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.815626  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0520  23S ribosomal RNA  98.35 
 
 
2891 bp  3146    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r02  23S ribosomal RNA  91.67 
 
 
3163 bp  2111    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0039  23S ribosomal RNA  90.7 
 
 
2911 bp  1608    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0034  23S ribosomal RNA  90.7 
 
 
2911 bp  1608    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0020  23S ribosomal RNA  89.16 
 
 
2884 bp  1164    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0024  23S ribosomal RNA  89.69 
 
 
2885 bp  1158    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0033  23S ribosomal RNA  89.16 
 
 
2884 bp  1164    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0057  23S ribosomal RNA  89.16 
 
 
2884 bp  1164    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.389269  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1264  23S ribosomal RNA  100 
 
 
3084 bp  3495    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1520  23S ribosomal RNA  100 
 
 
3084 bp  3495    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.614168  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1714  23S ribosomal RNA  99.39 
 
 
2795 bp  5394    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1707  23S ribosomal RNA  99.32 
 
 
2794 bp  5370    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1727  23S ribosomal RNA  99.43 
 
 
2796 bp  5410    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2337  23S ribosomal RNA  93.35 
 
 
2888 bp  1850    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.49451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2341  23S ribosomal RNA  93.35 
 
 
2888 bp  1850    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2338  23S ribosomal RNA  93.35 
 
 
2888 bp  1850    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0154  23S ribosomal RNA  94.94 
 
 
2781 bp  1790    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0508  23S ribosomal RNA  94.94 
 
 
2781 bp  1790    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0295614  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0594  23S ribosomal RNA  94.94 
 
 
2781 bp  1790    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0012  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 
2882 bp  597  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0296942  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0006  23S ribosomal RNA  83.76 
 
 
2882 bp  597  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000647152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0012  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 
2883 bp  589  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.217714  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0006  23S ribosomal RNA  83.64 
 
 
2883 bp  589  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00784205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0057  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2640 bp  539  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0047  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2640 bp  539  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0038  23S ribosomal RNA  87.59 
 
 
2640 bp  539  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.100102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2908 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  87.34 
 
 
2907 bp  533  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0031  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2850 bp  531  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0057  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2902 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842321  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0059  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2653 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0816838  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0071  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2850 bp  531  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.764689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0060  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2954 bp  531  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0036  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2850 bp  531  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0021  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2954 bp  531  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0046  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2902 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0039  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2634 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563029  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0048  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2634 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0037  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2902 bp  531  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0070  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2954 bp  531  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0021  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2850 bp  531  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.335485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0055  23S ribosomal RNA  87.41 
 
 
2954 bp  531  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2909 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2909 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2908 bp  525  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2851 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2912 bp  525  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2911 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 
2912 bp  525  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>