More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0024 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0154  23S ribosomal RNA  88 
 
 		 2781 bp  801    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0040  23S ribosomal RNA  89.69 
 
 		 3045 bp  1158    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.339342  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0594  23S ribosomal RNA  88 
 
 		 2781 bp  801    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SA  23S ribosomal RNA  89.59 
 
 		 3063 bp  1150    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SB  23S ribosomal RNA  89.59 
 
 		 3063 bp  1150    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SC  23S ribosomal RNA  89.59 
 
 		 3063 bp  1150    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0034  23S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 2911 bp  1411    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1798  23S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 2894 bp  706    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1264  23S ribosomal RNA  89.69 
 
 		 3084 bp  1158    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0052  23S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 2911 bp  1411    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1707  23S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 2794 bp  1108    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0508  23S ribosomal RNA  88 
 
 		 2781 bp  801    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0295614  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0520  23S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 2891 bp  973    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1462  23S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 2891 bp  973    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0463  23S ribosomal RNA  87.98 
 
 		 2891 bp  973    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.815626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1801  23S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 2894 bp  706    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.267192  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1520  23S ribosomal RNA  89.69 
 
 		 3084 bp  1158    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.614168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0039  23S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 2911 bp  1411    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2337  23S ribosomal RNA  88.92 
 
 		 2888 bp  1235    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.49451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2338  23S ribosomal RNA  88.92 
 
 		 2888 bp  1235    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2341  23S ribosomal RNA  88.92 
 
 		 2888 bp  1235    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1727  23S ribosomal RNA  90.01 
 
 		 2796 bp  1116    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1714  23S ribosomal RNA  89.91 
 
 		 2795 bp  1100    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0020  23S ribosomal RNA  99.97 
 
 		 2884 bp  5709    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0024  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2885 bp  5719    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0033  23S ribosomal RNA  99.97 
 
 		 2884 bp  5709    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0057  23S ribosomal RNA  99.97 
 
 		 2884 bp  5709    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.389269  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r02  23S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 3163 bp  1237    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1804  23S ribosomal RNA  84.34 
 
 		 2894 bp  706    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r03  23S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 3163 bp  1237    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r05  23S ribosomal RNA  89.09 
 
 		 3163 bp  1237    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0031  23S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 2850 bp  617  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0036  23S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 2850 bp  617  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0021  23S ribosomal RNA  82.92 
 
 		 2850 bp  617  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.335485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0060  23S ribosomal RNA  82.82 
 
 		 2954 bp  609  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0071  23S ribosomal RNA  82.82 
 
 		 2850 bp  609  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.764689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0070  23S ribosomal RNA  82.82 
 
 		 2954 bp  609  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0055  23S ribosomal RNA  82.82 
 
 		 2954 bp  609  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0021  23S ribosomal RNA  82.82 
 
 		 2954 bp  609  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0013  23S ribosomal RNA  82.19 
 
 		 2605 bp  563  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0057  23S ribosomal RNA  82.19 
 
 		 2605 bp  563  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0021  23S ribosomal RNA  82.19 
 
 		 2605 bp  563  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0069  23S ribosomal RNA  82.19 
 
 		 2605 bp  563  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0021  23S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 2914 bp  517  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0165  23S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 2914 bp  517  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1706  23S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 2914 bp  517  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1833  23S ribosomal RNA  87.15 
 
 		 2914 bp  517  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0037  23S ribosomal RNA  86.92 
 
 		 2902 bp  513  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0057  23S ribosomal RNA  86.92 
 
 		 2902 bp  513  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0046  23S ribosomal RNA  86.92 
 
 		 2902 bp  513  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1083  23S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 2820 bp  511  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.494767  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0261  23S ribosomal RNA  86.9 
 
 		 2820 bp  511  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0655  23S ribosomal RNA  86.94 
 
 		 2888 bp  507  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1371  23S ribosomal RNA  86.94 
 
 		 2888 bp  507  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0039  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 2634 bp  505  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0038  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 2640 bp  505  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0057  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 2640 bp  505  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0048  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 2634 bp  505  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0059  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 2653 bp  505  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0816838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0047  23S ribosomal RNA  86.74 
 
 		 2640 bp  505  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  86.78 
 
 		 2922 bp  502  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  86.78 
 
 		 2922 bp  502  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  86.78 
 
 		 2922 bp  502  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  86.78 
 
 		 2922 bp  502  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  86.78 
 
 		 2922 bp  502  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  86.78 
 
 		 2922 bp  502  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0061  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2556 bp  498  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0024  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2556 bp  498  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0314547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0045  23S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 2984 bp  500  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0018  23S ribosomal RNA  91.49 
 
 		 2984 bp  500  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.390452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0035  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2556 bp  498  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.381491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0024  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2847 bp  498  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00320172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0051  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2556 bp  498  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0486976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0008  23S ribosomal RNA  86.65 
 
 		 2847 bp  498  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237981  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2923 bp  494  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2923 bp  494  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2923 bp  494  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2923 bp  494  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2923 bp  494  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2923 bp  494  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2923 bp  494  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  86.59 
 
 		 2923 bp  494  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0006  23S ribosomal RNA  86.92 
 
 		 2923 bp  492  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0022  23S ribosomal RNA  86.92 
 
 		 2923 bp  492  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0021  23S ribosomal RNA  86.92 
 
 		 2923 bp  492  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0006  23S ribosomal RNA  86.92 
 
 		 2923 bp  492  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0041  23S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 2875 bp  492  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0051  23S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 2875 bp  492  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0043  23S ribosomal RNA  86.47 
 
 		 2983 bp  490  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000000749297 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0063  23S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 2924 bp  484  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00771367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0049  23S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 2925 bp  484  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1790  23S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 2931 bp  486  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0829238  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1018  23S ribosomal RNA  86.49 
 
 		 2931 bp  486  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0078  23S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 2925 bp  484  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0025  23S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 2925 bp  484  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.610781  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0010  23S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 2925 bp  484  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0004  23S ribosomal RNA  86.38 
 
 		 2925 bp  484  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0048  23S ribosomal RNA  81.36 
 
 		 3384 bp  484  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770601 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1798  23S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 2631 bp  484  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.25169e-21 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1804  23S ribosomal RNA  86.13 
 
 		 2631 bp  484  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000784168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>