More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0508 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1804  23S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 2894 bp  2317    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1798  23S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 2894 bp  2317    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1462  23S ribosomal RNA  92.74 
 
 		 2891 bp  2103    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0052  23S ribosomal RNA  89.43 
 
 		 2911 bp  1752    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SA  23S ribosomal RNA  92.83 
 
 		 3063 bp  2091    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SB  23S ribosomal RNA  92.83 
 
 		 3063 bp  2091    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SC  23S ribosomal RNA  92.83 
 
 		 3063 bp  2091    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1520  23S ribosomal RNA  94.94 
 
 		 3084 bp  1790    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.614168  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0594  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2781 bp  5513    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1727  23S ribosomal RNA  92.71 
 
 		 2796 bp  2076    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0508  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2781 bp  5513    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0295614  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1264  23S ribosomal RNA  94.94 
 
 		 3084 bp  1790    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0034  23S ribosomal RNA  89.43 
 
 		 2911 bp  1752    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0520  23S ribosomal RNA  92.74 
 
 		 2891 bp  2103    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0039  23S ribosomal RNA  89.43 
 
 		 2911 bp  1752    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r05  23S ribosomal RNA  94.45 
 
 		 3163 bp  2409    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0463  23S ribosomal RNA  92.74 
 
 		 2891 bp  2103    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.815626  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0020  23S ribosomal RNA  88 
 
 		 2884 bp  801    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0024  23S ribosomal RNA  88 
 
 		 2885 bp  801    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0033  23S ribosomal RNA  88 
 
 		 2884 bp  801    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0057  23S ribosomal RNA  88 
 
 		 2884 bp  801    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.389269  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r02  23S ribosomal RNA  94.45 
 
 		 3163 bp  2409    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2341  23S ribosomal RNA  94.07 
 
 		 2888 bp  2302    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2337  23S ribosomal RNA  94.07 
 
 		 2888 bp  2302    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.49451  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2338  23S ribosomal RNA  94.07 
 
 		 2888 bp  2302    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0154  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2781 bp  5513    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1714  23S ribosomal RNA  92.64 
 
 		 2795 bp  2060    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1707  23S ribosomal RNA  92.64 
 
 		 2794 bp  2068    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1801  23S ribosomal RNA  93.86 
 
 		 2894 bp  2317    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.267192  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0040  23S ribosomal RNA  94.94 
 
 		 3045 bp  1790    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.339342  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r03  23S ribosomal RNA  94.45 
 
 		 3163 bp  2409    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2907 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2907 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2908 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2907 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2907 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2907 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2908 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2907 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2908 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2907 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2907 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2909 bp  551  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2908 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  88.84 
 
 		 2907 bp  551  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2909 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2909 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2909 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2926 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0034  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2909 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0185  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2909 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000705814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2851 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0105  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2909 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2912 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2912 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2912 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0010  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2909 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0263199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2911 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2912 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 2908 bp  543  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>