More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_r03 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0520  23S ribosomal RNA  91.72 
 
 
2891 bp  2147    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0154  23S ribosomal RNA  94.45 
 
 
2781 bp  2409    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1801  23S ribosomal RNA  94.17 
 
 
2894 bp  2002    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.267192  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2337  23S ribosomal RNA  96.29 
 
 
2888 bp  2847    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.49451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0508  23S ribosomal RNA  94.45 
 
 
2781 bp  2409    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0295614  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0040  23S ribosomal RNA  91.67 
 
 
3045 bp  2111    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.339342  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1798  23S ribosomal RNA  94.17 
 
 
2894 bp  2002    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SA  23S ribosomal RNA  92.03 
 
 
3063 bp  2159    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SB  23S ribosomal RNA  92.03 
 
 
3063 bp  2159    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SC  23S ribosomal RNA  92.03 
 
 
3063 bp  2159    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1804  23S ribosomal RNA  94.17 
 
 
2894 bp  2002    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1707  23S ribosomal RNA  92.28 
 
 
2794 bp  2008    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1727  23S ribosomal RNA  92.35 
 
 
2796 bp  2016    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1714  23S ribosomal RNA  92.28 
 
 
2795 bp  2000    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0594  23S ribosomal RNA  94.45 
 
 
2781 bp  2409    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r02  23S ribosomal RNA  100 
 
 
3163 bp  6270    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r03  23S ribosomal RNA  100 
 
 
3163 bp  6270    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2338  23S ribosomal RNA  96.29 
 
 
2888 bp  2847    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2341  23S ribosomal RNA  96.29 
 
 
2888 bp  2847    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1462  23S ribosomal RNA  91.72 
 
 
2891 bp  2147    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r05  23S ribosomal RNA  100 
 
 
3163 bp  6270    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0034  23S ribosomal RNA  89.46 
 
 
2911 bp  1933    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0039  23S ribosomal RNA  89.46 
 
 
2911 bp  1933    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0052  23S ribosomal RNA  89.46 
 
 
2911 bp  1933    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0020  23S ribosomal RNA  89.09 
 
 
2884 bp  1237    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0024  23S ribosomal RNA  89.09 
 
 
2885 bp  1237    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0033  23S ribosomal RNA  89.09 
 
 
2884 bp  1237    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0057  23S ribosomal RNA  89.09 
 
 
2884 bp  1237    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.389269  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0463  23S ribosomal RNA  91.72 
 
 
2891 bp  2147    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.815626  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1520  23S ribosomal RNA  91.67 
 
 
3084 bp  2111    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.614168  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1264  23S ribosomal RNA  91.67 
 
 
3084 bp  2111    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2908 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2908 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2908 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2933 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0010  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2944 bp  547  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2935 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2933 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0059  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2943 bp  547  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.12329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2907 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2907 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2907 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2907 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2909 bp  549  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2933 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2933 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2933 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2932 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2933 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2933 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2933 bp  549  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0028  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2946 bp  547  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0002  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2944 bp  547  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0115093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0031  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2946 bp  547  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.196747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0050  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2946 bp  547  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.074771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2907 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2907 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2907 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2907 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2907 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2908 bp  549  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0092  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2909 bp  541  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0130944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2909 bp  541  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2909 bp  541  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2851 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2912 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2912 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2911 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2912 bp  541  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0185  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2909 bp  541  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000705814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 
2908 bp  541  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>