299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_R0006 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_23SA  23S ribosomal RNA  92.62 
 
 		 2902 bp  1445    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145616  hitchhiker  0.000134511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SB  23S ribosomal RNA  92.62 
 
 		 2902 bp  1445    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  hitchhiker  0.000114916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SC  23S ribosomal RNA  92.62 
 
 		 2902 bp  1445    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0640928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SD  23S ribosomal RNA  92.62 
 
 		 2902 bp  1445    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SE  23S ribosomal RNA  92.62 
 
 		 2902 bp  1445    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564865  normal  0.184682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SF  23S ribosomal RNA  92.62 
 
 		 2902 bp  1445    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SG  23S ribosomal RNA  92.62 
 
 		 2902 bp  1445    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SA  23S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 2904 bp  1294    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc23SB  23S ribosomal RNA  91.04 
 
 		 2904 bp  1294    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r002  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2893 bp  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r005  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2893 bp  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r008  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2894 bp  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r011  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2893 bp  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r014  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2893 bp  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r017  23S ribosomal RNA  87.55 
 
 		 2893 bp  1168    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r020  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2893 bp  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r023  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2893 bp  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r026  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2893 bp  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r02  23S ribosomal RNA  92.53 
 
 		 2903 bp  1423    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r05  23S ribosomal RNA  92.53 
 
 		 2903 bp  1423    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r08  23S ribosomal RNA  92.53 
 
 		 2903 bp  1423    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r11  23S ribosomal RNA  92.53 
 
 		 2903 bp  1423    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r14  23S ribosomal RNA  92.53 
 
 		 2903 bp  1423    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701415  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr02  23S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 2783 bp  1338    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr05  23S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 2783 bp  1338    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr08  23S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 2861 bp  1338    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr02  23S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 2861 bp  1338    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr05  23S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 2861 bp  1338    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr08  23S ribosomal RNA  89.56 
 
 		 2861 bp  1338    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA16  23S ribosomal RNA  92.53 
 
 		 2903 bp  1423    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.048152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA49  23S ribosomal RNA  92.53 
 
 		 2903 bp  1423    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832187  normal  0.473588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA7  23S ribosomal RNA  92.53 
 
 		 2903 bp  1423    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.685402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA71  23S ribosomal RNA  92.43 
 
 		 2903 bp  1415    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0658993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA80  23S ribosomal RNA  92.53 
 
 		 2903 bp  1423    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0495778  normal  0.0181156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0013  23S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 2913 bp  1259    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0027  23S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 2913 bp  1259    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R15  23S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 2892 bp  2438    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R4  23S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 2892 bp  2438    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R44  23S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 2892 bp  2438    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R57  23S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 2892 bp  2438    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R78  23S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 2892 bp  2438    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0420771  normal  0.0126919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R91  23S ribosomal RNA  86.55 
 
 		 2892 bp  2438    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000653016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0087  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2882 bp  1174    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564636  normal  0.192988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0010  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2882 bp  1174    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0501541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0018  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2882 bp  1174    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000431257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0028  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2882 bp  1174    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0640603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0072  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2882 bp  1174    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560975  normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0004  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2882 bp  1174    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0923304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0035  23S ribosomal RNA  87.94 
 
 		 2861 bp  1221    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.249297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0042  23S ribosomal RNA  87.94 
 
 		 2861 bp  1221    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0050  23S ribosomal RNA  87.94 
 
 		 2861 bp  1221    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0014  23S ribosomal RNA  85.76 
 
 		 2872 bp  1951    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0042  23S ribosomal RNA  85.76 
 
 		 2872 bp  1951    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0004  23S ribosomal RNA  90.33 
 
 		 2897 bp  1269    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0014  23S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 2897 bp  1277    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0058  23S ribosomal RNA  90.33 
 
 		 2897 bp  1269    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0076  23S ribosomal RNA  90.33 
 
 		 2898 bp  1269    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0084  23S ribosomal RNA  90.43 
 
 		 2897 bp  1277    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0003  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 2881 bp  1166    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0037  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 2881 bp  1166    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169917  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0052  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 2882 bp  1166    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0063  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 2881 bp  1166    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0822866  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0074  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2881 bp  1174    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407345  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0086  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2881 bp  1174    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0007  23S ribosomal RNA  88.42 
 
 		 2898 bp  1289    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0012  23S ribosomal RNA  88.42 
 
 		 2898 bp  1289    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0002  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 2882 bp  1181    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0458298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0010  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 2882 bp  1181    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0131744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0020  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 2882 bp  1181    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00244053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0064  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 2882 bp  1181    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0081  23S ribosomal RNA  87.33 
 
 		 2882 bp  1189    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232071  normal  0.0354875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0087  23S ribosomal RNA  87.25 
 
 		 2882 bp  1181    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00689972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08600  23S ribosomal RNA  92.43 
 
 		 2891 bp  1429    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55631  23S ribosomal RNA  91.47 
 
 		 2884 bp  1326    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62060  23S ribosomal RNA  92.33 
 
 		 2891 bp  1421    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0546487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70880  23S ribosomal RNA  92.43 
 
 		 2891 bp  1429    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.560692 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0002  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 2882 bp  1166    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522132  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0010  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 2882 bp  1166    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0290682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0019  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 2882 bp  1166    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0062  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2882 bp  1174    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.604931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_R0078  23S ribosomal RNA  87.08 
 
 		 2881 bp  1166    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.0353755 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_R0085  23S ribosomal RNA  87.16 
 
 		 2881 bp  1174    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.271207  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0009  23S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 2900 bp  1289    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.517564  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0019  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2900 bp  1281    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00407691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0056  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 2900 bp  1281    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0002  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198027  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0005  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0011  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.471392  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0023  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0070  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0116  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0120  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.569814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0128  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0135  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.224247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0141  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2903 bp  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.665611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0002  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 		 2893 bp  1183    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.959463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0006  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 		 2893 bp  1183    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.232141  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0012  23S ribosomal RNA  87.71 
 
 		 2893 bp  1183    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0815988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0022  23S ribosomal RNA  87.79 
 
 		 2893 bp  1191    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0065  23S ribosomal RNA  87.63 
 
 		 2893 bp  1176    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.492717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>