299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_R0135 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_23SA  23S ribosomal RNA  85.75 
 
 
2902 bp  2363    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145616  hitchhiker  0.000134511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SB  23S ribosomal RNA  85.78 
 
 
2902 bp  2371    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  hitchhiker  0.000114916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SC  23S ribosomal RNA  85.86 
 
 
2902 bp  2373    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0640928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SD  23S ribosomal RNA  85.82 
 
 
2902 bp  2379    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507419  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SE  23S ribosomal RNA  85.85 
 
 
2902 bp  2377    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.564865  normal  0.184682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SF  23S ribosomal RNA  85.82 
 
 
2902 bp  2369    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201882  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_23SG  23S ribosomal RNA  85.85 
 
 
2902 bp  2377    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0037  23S ribosomal RNA  90.98 
 
 
2894 bp  1703    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0046  23S ribosomal RNA  90.98 
 
 
2894 bp  1703    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0052  23S ribosomal RNA  90.98 
 
 
2894 bp  1703    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0342  23S ribosomal RNA  90.98 
 
 
2894 bp  1703    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0348  23S ribosomal RNA  90.98 
 
 
2894 bp  1703    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0559  23S ribosomal RNA  90.98 
 
 
2894 bp  1703    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.683091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0565  23S ribosomal RNA  92.5 
 
 
2894 bp  1677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1611  23S ribosomal RNA  90.98 
 
 
2894 bp  1703    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3904  23S ribosomal RNA  92.5 
 
 
2894 bp  1677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r002  23S ribosomal RNA  96.28 
 
 
2893 bp  4892    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r005  23S ribosomal RNA  96.11 
 
 
2893 bp  4853    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r008  23S ribosomal RNA  96.35 
 
 
2894 bp  4916    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r011  23S ribosomal RNA  96.11 
 
 
2893 bp  4853    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r014  23S ribosomal RNA  96.28 
 
 
2893 bp  4892    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r017  23S ribosomal RNA  96.22 
 
 
2893 bp  4877    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r020  23S ribosomal RNA  96.11 
 
 
2893 bp  4853    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r023  23S ribosomal RNA  96.15 
 
 
2893 bp  4861    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r026  23S ribosomal RNA  96.28 
 
 
2893 bp  4892    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r02  23S ribosomal RNA  87.07 
 
 
2903 bp  2248    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r05  23S ribosomal RNA  87.07 
 
 
2903 bp  2248    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r08  23S ribosomal RNA  87.07 
 
 
2903 bp  2248    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r11  23S ribosomal RNA  87.07 
 
 
2903 bp  2248    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r14  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 
2903 bp  2240    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R15  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 
2892 bp  2206    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28387  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R4  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 
2892 bp  2206    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R44  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 
2892 bp  2206    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R57  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 
2892 bp  2206    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.344499  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R78  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 
2892 bp  2206    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0420771  normal  0.0126919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R91  23S ribosomal RNA  87.03 
 
 
2892 bp  2206    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000653016  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0035  23S ribosomal RNA  86.22 
 
 
2861 bp  2087    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.249297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0042  23S ribosomal RNA  86.22 
 
 
2861 bp  2087    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0050  23S ribosomal RNA  86.22 
 
 
2861 bp  2087    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0002  23S ribosomal RNA  96.59 
 
 
2905 bp  4964    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.905525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0010  23S ribosomal RNA  96.56 
 
 
2905 bp  4956    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0016  23S ribosomal RNA  96.52 
 
 
2905 bp  4948    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.427778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0047  23S ribosomal RNA  96.66 
 
 
2905 bp  4980    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0106  23S ribosomal RNA  96.7 
 
 
2905 bp  4988    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.492781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0116  23S ribosomal RNA  96.56 
 
 
2905 bp  4956    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0121  23S ribosomal RNA  96.59 
 
 
2905 bp  4964    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0126  23S ribosomal RNA  96.59 
 
 
2905 bp  4964    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0004  23S ribosomal RNA  91.87 
 
 
2885 bp  1729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0961253  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0011  23S ribosomal RNA  91.87 
 
 
2885 bp  1729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0019  23S ribosomal RNA  91.87 
 
 
2885 bp  1729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0026  23S ribosomal RNA  91.87 
 
 
2885 bp  1729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0080  23S ribosomal RNA  91.87 
 
 
2885 bp  1729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.357348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0002  23S ribosomal RNA  95.6 
 
 
2893 bp  4728    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.492003  hitchhiker  0.00473622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0010  23S ribosomal RNA  95.98 
 
 
2893 bp  4821    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150973  normal  0.511936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0017  23S ribosomal RNA  96.11 
 
 
2893 bp  4853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000288824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0074  23S ribosomal RNA  96.15 
 
 
2893 bp  4861    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0122  23S ribosomal RNA  96.15 
 
 
2893 bp  4861    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.750631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0131  23S ribosomal RNA  96.11 
 
 
2893 bp  4853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.595604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0135  23S ribosomal RNA  95.98 
 
 
2893 bp  4821    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  hitchhiker  0.00197416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0139  23S ribosomal RNA  96.11 
 
 
2893 bp  4853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.746885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0142  23S ribosomal RNA  95.98 
 
 
2893 bp  4821    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.080759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0002  23S ribosomal RNA  95.84 
 
 
2893 bp  4774    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0010  23S ribosomal RNA  95.73 
 
 
2893 bp  4760    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0173103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0017  23S ribosomal RNA  95.73 
 
 
2893 bp  4750    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0023  23S ribosomal RNA  95.7 
 
 
2893 bp  4752    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00167736  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0027  23S ribosomal RNA  95.8 
 
 
2893 bp  4775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.206108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0074  23S ribosomal RNA  95.87 
 
 
2893 bp  4797    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0122  23S ribosomal RNA  95.83 
 
 
2893 bp  4787    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.969635 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0140  23S ribosomal RNA  95.7 
 
 
2893 bp  4742    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0143  23S ribosomal RNA  95.73 
 
 
2894 bp  4754    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0002  23S ribosomal RNA  96.28 
 
 
2916 bp  4879    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0007  23S ribosomal RNA  96.28 
 
 
2916 bp  4879    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0014  23S ribosomal RNA  96.25 
 
 
2916 bp  4871    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0028  23S ribosomal RNA  96.25 
 
 
2915 bp  4863    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.116759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0031  23S ribosomal RNA  96.25 
 
 
2916 bp  4871    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0064  23S ribosomal RNA  96.22 
 
 
2916 bp  4863    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0120  23S ribosomal RNA  96.28 
 
 
2916 bp  4879    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0125  23S ribosomal RNA  96.28 
 
 
2916 bp  4879    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.362586  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0132  23S ribosomal RNA  96.28 
 
 
2916 bp  4879    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0002  23S ribosomal RNA  95.53 
 
 
2895 bp  4718    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0010  23S ribosomal RNA  95.56 
 
 
2895 bp  4726    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.439393  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0017  23S ribosomal RNA  95.98 
 
 
2895 bp  4821    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000617374 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0072  23S ribosomal RNA  95.6 
 
 
2895 bp  4734    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.130821  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0119  23S ribosomal RNA  95.91 
 
 
2895 bp  4803    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0129  23S ribosomal RNA  95.97 
 
 
2895 bp  4819    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.332932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0133  23S ribosomal RNA  95.97 
 
 
2895 bp  4819    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00116115  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0139  23S ribosomal RNA  95.94 
 
 
2895 bp  4811    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0142  23S ribosomal RNA  95.91 
 
 
2896 bp  4797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0002  23S ribosomal RNA  94.39 
 
 
2914 bp  4435    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0007  23S ribosomal RNA  94.32 
 
 
2914 bp  4433    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.242783  hitchhiker  0.00573728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0015  23S ribosomal RNA  94.46 
 
 
2914 bp  4450    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631469  normal  0.115726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0020  23S ribosomal RNA  94.39 
 
 
2914 bp  4435    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.879348  normal  0.651924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0025  23S ribosomal RNA  94.39 
 
 
2914 bp  4435    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278632  unclonable  0.0000171921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0053  23S ribosomal RNA  94.39 
 
 
2914 bp  4435    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0111  23S ribosomal RNA  94.36 
 
 
2914 bp  4427    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210814  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0131  23S ribosomal RNA  94.39 
 
 
2914 bp  4435    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313678  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0004  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 
2892 bp  1588    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.09917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0008  23S ribosomal RNA  90.14 
 
 
2892 bp  1590    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0016  23S ribosomal RNA  90.21 
 
 
2892 bp  1598    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0033  23S ribosomal RNA  90.29 
 
 
2892 bp  1596    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>