More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1965 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1965  ribosomal protein L2  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000977898  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  85.51 
 
 		 276 aa  490  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1029  50S ribosomal protein L2  83.39 
 
 		 277 aa  478  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000494173  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1872  50S ribosomal protein L2  82.97 
 
 		 276 aa  474  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.701919  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0062  50S ribosomal protein L2  82.97 
 
 		 276 aa  476  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000124196  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  82.31 
 
 		 277 aa  474  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000147687  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1701  50S ribosomal protein L2  82.61 
 
 		 276 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371548  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2078  50S ribosomal protein L2  82.61 
 
 		 276 aa  471  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000477294  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0087  50S ribosomal protein L2  80.07 
 
 		 276 aa  448  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.025242  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  75.18 
 
 		 279 aa  435  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 277 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  61.96 
 
 		 276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  60.44 
 
 		 274 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  61.59 
 
 		 276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  61.23 
 
 		 276 aa  332  4e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  62.32 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  62.18 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 275 aa  328  6e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 		 275 aa  327  9e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  59.06 
 
 		 275 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  58.57 
 
 		 279 aa  322  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  58.55 
 
 		 276 aa  320  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 277 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 276 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 		 277 aa  316  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 		 277 aa  316  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  57.19 
 
 		 278 aa  315  5e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  58.63 
 
 		 277 aa  315  6e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 276 aa  315  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 		 277 aa  315  6e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 276 aa  315  7e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 276 aa  314  9e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 276 aa  314  9e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 276 aa  314  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 276 aa  314  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 276 aa  314  9e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 276 aa  314  9e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 276 aa  314  9e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  60.44 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 273 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  58.33 
 
 		 279 aa  312  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  59.42 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  58.48 
 
 		 280 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 		 274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 275 aa  312  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 		 274 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0693  50S ribosomal protein L2  58.87 
 
 		 281 aa  311  9e-84  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  58.42 
 
 		 277 aa  310  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  58.42 
 
 		 277 aa  310  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  58.03 
 
 		 275 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  55.11 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  59.07 
 
 		 281 aa  308  4e-83  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  57.2 
 
 		 279 aa  308  5.9999999999999995e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  57.35 
 
 		 277 aa  308  6.999999999999999e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  58.97 
 
 		 274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  58.93 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  59.49 
 
 		 275 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  59.29 
 
 		 277 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  58.76 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 		 274 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 279 aa  306  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  58.84 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  57.88 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  55.27 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 280 aa  305  7e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 279 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 279 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  56.2 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1335  50S ribosomal protein L2  56.41 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0836019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1792  50S ribosomal protein L2  57.51 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109634  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  54.91 
 
 		 273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  58.12 
 
 		 280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1433  50S ribosomal protein L2  56.04 
 
 		 278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  0.0219433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  59.19 
 
 		 287 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0989  50S ribosomal protein L2  55.68 
 
 		 278 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.0318056 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1282  ribosomal protein L2  56 
 
 		 275 aa  301  6.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1843  50S ribosomal protein L2  55.07 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0328595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  53.99 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 274 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 274 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0249  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 276 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  53.96 
 
 		 274 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0246  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 276 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  53.65 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  57.88 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  53.65 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  56.88 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  54.18 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>