49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0552 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  98.27 
 
 
231 aa  470  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  97.4 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  97.4 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  55.51 
 
 
237 aa  265  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  48.68 
 
 
231 aa  261  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  40.97 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  38.63 
 
 
249 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  38.43 
 
 
237 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  37.28 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  34.63 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  34.93 
 
 
230 aa  161  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  35.96 
 
 
232 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  34.89 
 
 
248 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  36.36 
 
 
245 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  33.77 
 
 
247 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  35.06 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  35.77 
 
 
246 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  35.5 
 
 
243 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  34.48 
 
 
246 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  31.9 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  32.76 
 
 
245 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  34 
 
 
544 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  30.17 
 
 
239 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  32.74 
 
 
232 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  33.07 
 
 
245 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  39.6 
 
 
178 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  29.11 
 
 
338 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  32.64 
 
 
484 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  37.14 
 
 
70 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  32.12 
 
 
415 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  31.21 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  27.81 
 
 
393 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  26.75 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  26.6 
 
 
389 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  29.27 
 
 
400 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  28.05 
 
 
492 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  27.16 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4531  hypothetical protein  36.59 
 
 
271 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.889024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  29.52 
 
 
397 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  28.24 
 
 
396 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  29.52 
 
 
402 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  29.52 
 
 
402 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  28.14 
 
 
400 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06691  hypothetical protein  28.1 
 
 
388 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  22.42 
 
 
439 aa  45.1  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72172  predicted protein  22.49 
 
 
275 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2010  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  0.301205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>