48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2453 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  481  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  49.78 
 
 
237 aa  268  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  49.56 
 
 
231 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  49.56 
 
 
231 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  49.56 
 
 
231 aa  264  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  48.68 
 
 
231 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  37 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  39.74 
 
 
230 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  38.1 
 
 
232 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  38.7 
 
 
230 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  35.93 
 
 
247 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  35.93 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  36.68 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  37.55 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  36.29 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  35.63 
 
 
246 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  32.91 
 
 
244 aa  164  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  32.91 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  31.06 
 
 
245 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  32.34 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  32.05 
 
 
246 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  33 
 
 
544 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  31.22 
 
 
239 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  30.64 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  31.97 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  31.82 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  43.27 
 
 
178 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  29.75 
 
 
338 aa  82  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 
269 aa  77  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  25.13 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  26.95 
 
 
400 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  41.43 
 
 
70 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  24.23 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  27.65 
 
 
415 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  26.9 
 
 
389 aa  55.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  28.31 
 
 
393 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  27.44 
 
 
402 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  27.44 
 
 
402 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  26.9 
 
 
484 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  26.22 
 
 
492 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  25 
 
 
342 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  23.53 
 
 
397 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72172  predicted protein  20.7 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2010  hypothetical protein  25.89 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  0.301205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  25.68 
 
 
396 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  26.06 
 
 
400 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4531  hypothetical protein  30.65 
 
 
271 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.889024 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  22.73 
 
 
439 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>