41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2384 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  814    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  65.58 
 
 
415 aa  542  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  63.8 
 
 
402 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  63.8 
 
 
402 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  61.75 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  58.38 
 
 
393 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  59.9 
 
 
397 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  47.43 
 
 
396 aa  364  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1119  hypothetical protein  40.31 
 
 
398 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0692981  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1338  hypothetical protein  39.9 
 
 
392 aa  298  9e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.265714  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0040  hypothetical protein  39.06 
 
 
392 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18771  hypothetical protein  41.19 
 
 
407 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06301  hypothetical protein  37.5 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.949662  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0604  hypothetical protein  38.02 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06601  hypothetical protein  36.98 
 
 
390 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06691  hypothetical protein  38.81 
 
 
388 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06601  hypothetical protein  38.64 
 
 
392 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10461  hypothetical protein  36.27 
 
 
401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  40.51 
 
 
492 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  39.72 
 
 
483 aa  239  8e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  35.18 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  36.09 
 
 
484 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  29.95 
 
 
342 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  28.05 
 
 
389 aa  140  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  27.78 
 
 
231 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  28.74 
 
 
231 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  24.54 
 
 
232 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  27.33 
 
 
245 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  26.11 
 
 
243 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  28.14 
 
 
231 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  28.31 
 
 
231 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  26.51 
 
 
244 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  27.95 
 
 
236 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  27.71 
 
 
239 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  25.61 
 
 
245 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  23.95 
 
 
230 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  26.19 
 
 
239 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  25.6 
 
 
230 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  26.06 
 
 
231 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  25.87 
 
 
237 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  26.04 
 
 
247 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>