45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6868 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  80.75 
 
 		 239 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  54.17 
 
 		 243 aa  244  8e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  53.33 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  53.33 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  50.83 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  45.61 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  43.93 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  43.57 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  45.77 
 
 		 544 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  33.47 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  35.17 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  30.17 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  30.64 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  30.6 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  30.17 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  35.17 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  31.62 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  30.17 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  30.9 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  28.88 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  31.54 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  31.85 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  28.64 
 
 		 246 aa  88.6  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  28.32 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  25.51 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  29.56 
 
 		 338 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  38.57 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  36 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  32.65 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  28.34 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  30.14 
 
 		 400 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  28.16 
 
 		 415 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  23.11 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  25.49 
 
 		 492 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  26.38 
 
 		 402 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  26.38 
 
 		 402 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  28.17 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  25.33 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  26.19 
 
 		 400 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  22.73 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10461  hypothetical protein  24.34 
 
 		 401 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  24.43 
 
 		 393 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1119  hypothetical protein  27.63 
 
 		 398 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0692981  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4531  hypothetical protein  33.82 
 
 		 271 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.889024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>