46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1815 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  31.97 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  32.79 
 
 
231 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  32.38 
 
 
231 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  33.07 
 
 
231 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  31.97 
 
 
231 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  31.33 
 
 
230 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  28.74 
 
 
236 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  29.15 
 
 
237 aa  105  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  29.37 
 
 
230 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  27.35 
 
 
232 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  28.28 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  33.63 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  28.81 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  25.91 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  25.83 
 
 
338 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  26.41 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  25.7 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  26.14 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  26.82 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  30.68 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  25.51 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  26.53 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  25.2 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  25.51 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  27.71 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  24.3 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  27.91 
 
 
544 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  31.14 
 
 
396 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  24.65 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  28.4 
 
 
415 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  27.33 
 
 
400 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  32.58 
 
 
397 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  32.18 
 
 
393 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  25.44 
 
 
402 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72172  predicted protein  25.19 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  25.44 
 
 
402 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  24.88 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  35.71 
 
 
484 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0604  hypothetical protein  28.33 
 
 
388 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  23.59 
 
 
439 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06601  hypothetical protein  27.53 
 
 
390 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06301  hypothetical protein  31.18 
 
 
390 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.949662  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06691  hypothetical protein  26.97 
 
 
388 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  37.14 
 
 
70 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>