43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2922 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  91.06 
 
 		 247 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  61 
 
 		 245 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  59.83 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  59.41 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  57.74 
 
 		 245 aa  258  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  55.92 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  46.86 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  45.61 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  52.48 
 
 		 544 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  42.17 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  35.93 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  38.98 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  35.5 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  35.06 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  34.63 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  34.63 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  32.9 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  36.8 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  34.76 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  33.88 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  29.63 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  32.27 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  31.06 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  28.81 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  43.69 
 
 		 178 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  26.91 
 
 		 232 aa  88.6  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  27.67 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  40 
 
 		 70 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  31.01 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  29.96 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  25.14 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  30.32 
 
 		 389 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  29.8 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  30.13 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  25 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  29.52 
 
 		 400 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  25.7 
 
 		 439 aa  48.9  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02160  hypothetical protein  21.47 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  24.39 
 
 		 483 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  25.15 
 
 		 402 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  25.15 
 
 		 402 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>