46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1558 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  56.39 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  49.78 
 
 		 231 aa  268  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  55.95 
 
 		 231 aa  268  8e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  55.51 
 
 		 231 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  55.95 
 
 		 231 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  40.97 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  38.6 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  39.47 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  40.87 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  38.2 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  36.32 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  32.9 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  37.32 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  34.21 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  34.2 
 
 		 244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  29.87 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  34.2 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  33.76 
 
 		 248 aa  144  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  34.48 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  34.48 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  33.5 
 
 		 544 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  30.6 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  28.88 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  30.67 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  29.15 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  41 
 
 		 178 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  26.75 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  44.29 
 
 		 70 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  24.05 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  30.91 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  30.34 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  26.67 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  29.61 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  27.08 
 
 		 492 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  29.5 
 
 		 484 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  24.26 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  26.62 
 
 		 389 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  28.86 
 
 		 396 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  28.17 
 
 		 397 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  27.33 
 
 		 393 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  28.67 
 
 		 402 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  28.67 
 
 		 402 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4531  hypothetical protein  36.36 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.889024 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  24.38 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  25.87 
 
 		 400 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>