23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4908 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  40.17 
 
 
239 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4531  hypothetical protein  31.82 
 
 
271 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.889024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  25.13 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  24.65 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  26.67 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  27.47 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  25.32 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  27.16 
 
 
231 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  26.34 
 
 
232 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  27.04 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  26.61 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  27.92 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  26.37 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  28.17 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  25.38 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  27.18 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  27.23 
 
 
544 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  25.13 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  25.94 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2010  hypothetical protein  24.62 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  0.301205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>