48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0480 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  69.57 
 
 		 230 aa  338  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  64.63 
 
 		 232 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  58.59 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  39.74 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  38.6 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  37.72 
 
 		 231 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  38.16 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  36.84 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  37.28 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  39.13 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  34.03 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  31.98 
 
 		 246 aa  131  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  29.63 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  31.62 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  32.05 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  28.69 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  31.84 
 
 		 544 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  27.78 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  31.33 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  29.61 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  28.76 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  31.62 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  35.1 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  27.19 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  26.98 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  29.11 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  26.64 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  40.78 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  47.14 
 
 		 70 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  28.24 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  27.65 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  28.66 
 
 		 389 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  28.08 
 
 		 396 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  30.43 
 
 		 484 aa  52  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  26.29 
 
 		 397 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  25.14 
 
 		 393 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1119  hypothetical protein  28.1 
 
 		 398 aa  49.3  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0692981  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4908  hypothetical protein  26.37 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  26.47 
 
 		 402 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4531  hypothetical protein  22.49 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.889024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  26.47 
 
 		 402 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  30.57 
 
 		 492 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  23.95 
 
 		 400 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02160  hypothetical protein  24.37 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  25.17 
 
 		 342 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0040  hypothetical protein  24.18 
 
 		 392 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>