26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5398 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  48.54 
 
 		 249 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  43.27 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  41.58 
 
 		 231 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  45 
 
 		 247 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  43.69 
 
 		 247 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  50 
 
 		 244 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  50 
 
 		 243 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  40.59 
 
 		 231 aa  90.9  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  40.59 
 
 		 231 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  41 
 
 		 237 aa  87.8  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  39.6 
 
 		 231 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  44.44 
 
 		 544 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  51 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  42 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  46.46 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  31.75 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  40.78 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  43 
 
 		 246 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  39.81 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  37.14 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  36 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  33.01 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  33.01 
 
 		 246 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>