44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1897 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  493  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  61 
 
 		 247 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  59.67 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  56.97 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  56.56 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  53.88 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  55.51 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  44.4 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  43.57 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  47.03 
 
 		 544 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  39.68 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  38.43 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  36.32 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  36.8 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  40.08 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  31.06 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  35.5 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  35.02 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  32.33 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  32.39 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  27.78 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  28.63 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  42 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  27.98 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  27.71 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  29.14 
 
 		 484 aa  65.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  25.88 
 
 		 492 aa  65.1  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  38.57 
 
 		 70 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  26.97 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  26.44 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  26.59 
 
 		 415 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  25 
 
 		 400 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  27.59 
 
 		 342 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  25.81 
 
 		 389 aa  52  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  25.14 
 
 		 483 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  25.49 
 
 		 396 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  25.61 
 
 		 400 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  24.55 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  24.55 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  20.82 
 
 		 439 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>