33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30636 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  100 
 
 
483 aa  997    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  42.54 
 
 
492 aa  274  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  41.72 
 
 
415 aa  252  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  40.56 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  40.56 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  39.28 
 
 
397 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  39.72 
 
 
400 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  36.94 
 
 
393 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  38.89 
 
 
400 aa  230  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  38.76 
 
 
396 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1119  hypothetical protein  36.78 
 
 
398 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0692981  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10461  hypothetical protein  34.36 
 
 
401 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06301  hypothetical protein  31.86 
 
 
390 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.949662  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1338  hypothetical protein  34.64 
 
 
392 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.265714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06601  hypothetical protein  31.3 
 
 
390 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0604  hypothetical protein  31.28 
 
 
388 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06691  hypothetical protein  31.2 
 
 
388 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0040  hypothetical protein  32.48 
 
 
392 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  33.43 
 
 
439 aa  177  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18771  hypothetical protein  34.06 
 
 
407 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06601  hypothetical protein  33.9 
 
 
392 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  31.15 
 
 
484 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  32.88 
 
 
342 aa  129  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  28.53 
 
 
389 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  25.97 
 
 
232 aa  56.6  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  24.72 
 
 
243 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  25.61 
 
 
244 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  25.56 
 
 
245 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  25.14 
 
 
245 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  25.14 
 
 
246 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  25.64 
 
 
236 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  24.39 
 
 
247 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>