26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0040 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0040  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  788    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06601  hypothetical protein  94.13 
 
 
392 aa  730    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10461  hypothetical protein  60.72 
 
 
401 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1119  hypothetical protein  58.03 
 
 
398 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0692981  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1338  hypothetical protein  57.63 
 
 
392 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.265714  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18771  hypothetical protein  58.03 
 
 
407 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06601  hypothetical protein  58.89 
 
 
390 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0604  hypothetical protein  57.81 
 
 
388 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06301  hypothetical protein  58.36 
 
 
390 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.949662  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06691  hypothetical protein  55.99 
 
 
388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  38.12 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0024  hypothetical protein  38.57 
 
 
396 aa  292  7e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.750506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  37.79 
 
 
415 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2384  hypothetical protein  39.06 
 
 
400 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  37.02 
 
 
400 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  37.14 
 
 
393 aa  282  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  36.51 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  36.51 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  34.49 
 
 
492 aa  203  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30636  predicted protein  32.48 
 
 
483 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0819532  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  28.69 
 
 
439 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  28.75 
 
 
484 aa  120  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  32.95 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37092  predicted protein  26.98 
 
 
389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  27.27 
 
 
232 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  27.04 
 
 
232 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>