43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3468 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3468  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0908989  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3241  hypothetical protein  85.71 
 
 		 285 aa  363  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.784932  normal  0.111789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2946  hypothetical protein  48.09 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000405982  decreased coverage  0.00000258322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21290  hypothetical protein  50 
 
 		 369 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000179213  normal  0.0805722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3158  hypothetical protein  44.5 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000133093  hitchhiker  0.000163581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2040  hypothetical protein  44.68 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.681258  normal  0.442644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1895  hypothetical protein  44.71 
 
 		 228 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2289  hypothetical protein  42 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5242  hypothetical protein  43.92 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0993  hypothetical protein  39.01 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4899  hypothetical protein  37.64 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1746  hypothetical protein  34.33 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0922  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15760  hypothetical protein  38.38 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0643292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1522  hypothetical protein  37.08 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1185  hypothetical protein  35.29 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000104855  hitchhiker  0.00383042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1201  hypothetical protein  36.46 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8989  hypothetical protein  39.86 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1191  hypothetical protein  36.46 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1174  hypothetical protein  36.46 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13429  hypothetical protein  41.18 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000128583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1439  hypothetical protein  47.95 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3475  hypothetical protein  41.06 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  37.25 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  37.62 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  37.25 
 
 		 349 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0425  recA protein  38.38 
 
 		 348 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  36.05 
 
 		 358 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  36.27 
 
 		 355 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  36.27 
 
 		 355 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  36.27 
 
 		 355 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  36.27 
 
 		 355 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  37.8 
 
 		 345 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  37.37 
 
 		 343 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  35.29 
 
 		 347 aa  42.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  35.35 
 
 		 327 aa  42.4  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3351  recA protein  37.37 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  35.64 
 
 		 347 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  36.27 
 
 		 346 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4001  recA protein  37.37 
 
 		 373 aa  42.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.627229  normal  0.688491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  36.27 
 
 		 346 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  38.82 
 
 		 348 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  35.64 
 
 		 384 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>